RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 OR6C3Q9NZP0 311 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ST3GAL6Q9Y274 331 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 H7C417 338 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IMPA2O14732 288 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-39P01824 125 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FAM106CPP0CH98 169 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MPV17P39210 176 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GPR12P47775 334 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 REG1BP48304 166 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CDK10Q15131 360 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FAM120AOSQ5T036 256 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HES5Q5TA89 166 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SNX29P2Q8IUI4 249 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ENTHD1Q8IYW4 607 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TNRC6AQ8NDV7 1962 aaKnown RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF488Q96MN9 340 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 KLHDC3Q9BQ90 382 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MOB1AQ9H8S9 216 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC23A1Q9UHI7 598 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM212A6NML5 194 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TUSC2O75896 110 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PGA4P0DJD7 388 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PGA3P0DJD8 388 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 VDAC1P21796 283 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FXYD6P3P58550 94 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 B3GALT5-AS1P59052 145 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PSMA6P60900 246 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ISL1P61371 349 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PLAURQ03405 335 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF92Q03936 586 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FGL1Q08830 312 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FOXL1Q12952 345 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MMDQ15546 238 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 MESTQ5EB52 335 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 C6orf183Q5T699 404 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CMTM3Q96MX0 182 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OCSTAMPQ9BR26 566 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS22Q9GZN4 317 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 WNT5BQ9H1J7 359 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HES4Q9HCC6 221 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 LRP12Q9Y561 859 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DMDP11532 3685 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HEATR5AQ86XA9 2040 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ANKRD17O75179 2603 aaKnown RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TCRBV4S1A1TA0A5B7 111 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZAR1LA6NP61 321 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ADAM10O14672 748 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 KLF4O43474 513 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 APOA1P02647 267 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SERPINE2P07093 398 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ARSBP15848 533 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CD33P20138 364 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SPHARQ15513 63 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 KCNMB1Q16558 191 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SLC25A30Q5SVS4 291 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 NXNL2Q5VZ03 156 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PCSK4Q6UW60 755 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CMTM1Q8IZ96 169 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 WACQ9BTA9 647 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PROK2Q9HC23 129 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 R4GMQ9 66 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 STAB1Q9NY15 2570 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3-7A0A075B6H7 116 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM30CPA0ZSE6 113 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DVL1O14640 695 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 PRKYO43930 277 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 CPT2P23786 658 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ACSM3Q53FZ2 586 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR2B11Q5JQS5 317 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 DCDC5Q6ZRR9 648 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 SSX9Q7RTT3 188 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OR4S1Q8NGB4 309 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 OTOSQ8NHW6 89 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 AP3S1Q92572 193 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRC-201ENST00000348564 HAVCR1Q96D42 359 aa3.79□□□□□ -1.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms