RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331462.5

HOXD1-201, Transcript of homeobox D1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD1, Length 1,975 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1-201ENST00000331462 RAB13P51153 203 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM33P57088 247 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 NAT6Q93015 286 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 A0A0J9YW62 118 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SGCEO43556 437 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM187Q14656 261 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RSU1Q15404 277 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM42Q69YG0 159 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FOXRED2Q8IWF2 684 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 NAA60Q9H7X0 242 aa19.63■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 GJE1A6NN92 205 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 CXCL12P48061 93 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SSR4P51571 173 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 PIGPP57054 158 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 REEP6Q96HR9 211 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FAAP24Q9BTP7 215 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 IL36GQ9NZH8 169 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF391Q9UJN7 358 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 EML6Q6ZMW3 1958 aa19.62■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 MED12Q93074 2177 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 E5RGE8 158 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF728P0DKX0 622 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF100Q8IYN0 542 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SUCNR1Q9BXA5 334 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 NSG2Q9Y328 171 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 OR6C6A6NF89 314 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FARS2O95363 451 aaKnown RBP19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TAF9Q16594 264 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 Q6ZRG5 221 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 OR1F12Q8NHA8 337 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SRXN1Q9BYN0 137 aa19.61■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 H7C1Q1 480 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TNFSF11O14788 317 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ANGPTL7O43827 346 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RBP2P50120 134 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 HGFACQ04756 655 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SHEQ5VZ18 495 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 LYSMD4Q5XG99 296 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 COMMD1Q8N668 190 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 OR2AE1Q8NHA4 323 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 GLYATL2Q8WU03 294 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SULT4A1Q9BR01 284 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RNF122Q9H9V4 155 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 BIN3Q9NQY0 253 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 HS3ST3B1Q9Y662 390 aa19.6■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 CBR3O75828 277 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 UCP2P55851 309 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RAC3P60763 192 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 PDZK1IP1Q13113 114 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 AVPI1Q5T686 147 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KIRREL1Q96J84 757 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TMEM38BQ9NVV0 291 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 STARD10Q9Y365 291 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 MYO7BQ6PIF6 2116 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 PQLC2LA1A4F0 135 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KLF7O75840 302 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 MBPP02686 304 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FOLR2P14207 255 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 UCP3P55916 312 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 HMGN3Q15651 99 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 C18orf12Q96KH6 178 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RGCCQ9H4X1 137 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 KPTNQ9Y664 436 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 VCANP13611 3396 aa19.59■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ZNF850A8MQ14 1090 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 C9JQL5 133 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 OR5AC1P0C628 307 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 SEC11BP0C7V7 166 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 NFYBP25208 207 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 CD80P33681 288 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 B3GALT5-AS1P59052 145 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 GPR157Q5UAW9 335 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 CPT1CQ8TCG5 803 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 RXFP4Q8TDU9 374 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 ERGIC1Q969X5 290 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 BORCS8Q96FH0 119 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 BCO1Q9HAY6 547 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 PTRH2Q9Y3E5 179 aaKnown RBP19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa19.58■□□□□ 0.73
HOXD1-201ENST00000331462 OR8U9P0C7N5 309 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXD1-201ENST00000331462 RRADP55042 308 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXD1-201ENST00000331462 MLF1P58340 268 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXD1-201ENST00000331462 SWI5Q1ZZU3 235 aa19.57■□□□□ 0.72
HOXD1-201ENST00000331462 ABCA11PQ4W5N1 156 aa19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.1 ms