RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000309641.10

PDE4D-201, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,025 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-201ENST00000309641 ZP1P60852 638 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 ERVK11-1P61568 191 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 IL24Q13007 206 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 PDZK1IP1Q13113 114 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM155Q4W5P6 130 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 TEX36Q5VZQ5 186 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 POC1AQ8NBT0 407 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 OR10Z1Q8NGY1 313 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF671Q8TAW3 534 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 TECTBQ96PL2 329 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 CCL13Q99616 98 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 NRIP2Q9BQI9 281 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 RBFOX1Q9NWB1 397 aaKnown RBP7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.59□□□□□ -1.19
PDE4D-201ENST00000309641 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DOCK11Q5JSL3 2073 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SHISA3A0PJX4 238 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TRIM64CA6NLI5 447 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GPX5O75715 221 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ALX3O95076 343 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SFTPBP07988 381 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 UCHL1P09936 223 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FSTP19883 344 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 BCL3P20749 454 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GABRA5P31644 462 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR3A4PP47883 348 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PPP3R1P63098 170 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DDI2Q5TDH0 399 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 STUMQ69YW2 141 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF841Q6ZN19 808 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR51F2Q8NH61 342 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MUL1Q969V5 352 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PKIBQ9C010 78 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM138Q9NPI0 162 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 METRNQ9UJH8 293 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PCDHB10Q9UN67 800 aa7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FN1P02751 2386 aaKnown RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP7.58□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 A0A087WXM4 84 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR2AT4A6NND4 320 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 F5H0A9 414 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CCRL2O00421 344 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NXPH2O95156 264 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CDRT1O95170 752 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FSTL3O95633 263 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 PSG2P11465 335 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RPS2P15880 293 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DUSP1P28562 367 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 BDKRB2P30411 391 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SNU13P55769 128 aaKnown RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 LCN2P80188 198 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MICBQ29980 383 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DCDC5Q6ZRR9 648 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 LRRTM1Q86UE6 522 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 LYPD6Q86Y78 171 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CD177Q8N6Q3 437 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FAM216BQ8N7L0 139 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR10K1Q8NGX5 313 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FCGR1BQ92637 280 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GFI1Q99684 422 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HES4Q9HCC6 221 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NLKQ9UBE8 527 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 DNAJB11Q9UBS4 358 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HIVEP2P31629 2446 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RFPL4AA6NLU0 287 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TMPRSS2O15393 492 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ADAM20O43506 726 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TGFAP01135 160 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TMEM225BP0DP42 221 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 FOSL1P15407 271 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SRMP19623 302 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 ZNF93P35789 620 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CLEC9AQ6UXN8 241 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 SPICQ8N5J4 248 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CEP19Q96LK0 163 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 GPER1Q99527 375 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 OR51E2Q9H255 320 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 RNF167Q9H6Y7 350 aa7.57□□□□□ -1.2
PDE4D-201ENST00000309641 CNTD2Q9H8S5 307 aa7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.5 ms