RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 GAL3ST1Q99999 423 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ASH2LQ9UBL3 628 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 LOC100509620A0A075B734 347 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PPH5 198 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 MELTFP08582 738 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 LAP3P28838 519 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CRABP1P29762 137 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM244Q5VVB8 128 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ADAM5Q6NVV9 412 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PAQR4Q8N4S7 273 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM106AQ96A25 262 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD16AO95870 558 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ACTBP60709 375 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ACTG1P63261 375 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 KCTD9Q7L273 389 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF676Q8N7Q3 588 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 AKR1E2Q96JD6 320 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SULT4A1Q9BR01 284 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PRRG4Q9BZD6 226 aa17.73■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV3D-15A0A087WSY6 115 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 C9JQL5 133 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ACKR3P25106 362 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 HIST3H3Q16695 136 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OTPQ5XKR4 325 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF324BQ6AW86 544 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR10H5Q8NGA6 315 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OCSTAMPQ9BR26 566 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 LAMP5Q9UJQ1 280 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RAB5AP20339 215 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 POU3F4P49335 361 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RIDAP52758 137 aaKnown RBP17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CDPF1Q6NVV7 123 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DHRS11Q6UWP2 260 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF383Q8NA42 475 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR6N2Q8NGY6 317 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 C14orf144Q96I85 54 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR2S2Q9NQN1 319 aa17.72■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TEX13DA0A0J9YY54 714 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DAOP14920 347 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TEX30Q5JUR7 227 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PHYHD1Q5SRE7 291 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 THEM4Q5T1C6 240 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 BPIFB2Q8N4F0 458 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CISD2Q8N5K1 135 aaKnown RBP17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR2G2Q8NGZ5 317 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 GPX8Q8TED1 209 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CASTOR1Q8WTX7 329 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ATG5Q9H1Y0 275 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 WDR76Q9H967 626 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CYTL1Q9NRR1 136 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 C5orf51A6NDU8 294 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLC22A20A6NK97 555 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 GLP1RP43220 463 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CLINT1Q14677 625 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PYY3Q5JQD4 70 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DNM1P34Q6PK57 102 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DRAM2Q6UX65 266 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DPY19L4Q7Z388 723 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CDC20BQ86Y33 519 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM54Q969K7 222 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 MCHR2Q969V1 340 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLAMF9Q96A28 289 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RAB3CQ96E17 227 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 MEGF10Q96KG7 1140 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OPA3Q9H6K4 179 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CLCF1Q9UBD9 225 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CACFD1Q9UGQ2 172 aa17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP17.71■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CSNK1A1P48729 337 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RAB5CP51148 216 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 NAAAQ02083 359 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PPP1R1AQ13522 171 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 NKPD1Q17RQ9 610 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TUSC5Q8IXB3 177 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF565Q8N9K5 539 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 CHMP1AQ9HD42 196 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 SVILO95425 2214 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 HLA-DQA2P01906 255 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PSMB6P28072 239 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 GLO1Q04760 184 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF585AQ6P3V2 769 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF627Q7L945 461 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 AAED1Q7RTV5 226 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 PRSS35Q8N3Z0 413 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM45BQ96B21 275 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 COMMD4Q9H0A8 199 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 BCO1Q9HAY6 547 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 VSIG4Q9Y279 399 aa17.7■□□□□ 0.42
UBE2B-201ENST00000265339 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.2 ms