RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000248139.7

RAB40C-201, Transcript of RAB40C, member RAS oncogene family, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RAB40C, Length 2,699 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40C-201ENST00000248139 RAB19A4D1S5 217 aa22.21■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 SLC23A3Q6PIS1 610 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa22.21■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 PHLDA2Q53GA4 152 aa22.21■■□□□ 1.15
RAB40C-201ENST00000248139 OR1F12Q8NHA8 337 aa22.21■■□□□ 1.15
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RAB40C-201ENST00000248139 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa22.18■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 MED6O75586 246 aa22.18■■□□□ 1.14
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RAB40C-201ENST00000248139 AIFM2Q9BRQ8 373 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 MMP26Q9NRE1 261 aa22.16■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 CCL2P13500 99 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 STK11Q15831 433 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 ESX1Q8N693 406 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 FOXB1Q99853 325 aa22.15■■□□□ 1.14
RAB40C-201ENST00000248139 WNT5BQ9H1J7 359 aa22.15■■□□□ 1.14
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