RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000236273.8

SYF2-201, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYF2, Length 1,345 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-201ENST00000236273 OR13C9Q8NGT0 318 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 GPR148Q8TDV2 347 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RAB40AQ8WXH6 277 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MYDGFQ969H8 173 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 BORCS8Q96FH0 119 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 GAFA1Q96PS6 74 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DNAJB11Q9UBS4 358 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DHDHQ9UQ10 334 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR2AT4A6NND4 320 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SOX2P48431 317 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RBP2P50120 134 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 BATF2Q8N1L9 274 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SPSB1Q96BD6 273 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TMIGD2Q96BF3 282 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR5M11Q96RB7 305 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DNTTIP1Q9H147 329 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 C7orf69Q9H7B7 122 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ERGIC3Q9Y282 383 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TPRKBQ9Y3C4 175 aa18.49■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 LOC105371242A0A075B767 164 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MYL12BO14950 172 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CD1AP06126 327 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PRKACBP22694 351 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ATP1B3P54709 279 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MTCP1P56278 107 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ACSM1Q08AH1 577 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR5D14Q8NGL3 314 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OPALINQ96PE5 141 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SPACA5Q96QH8 159 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR5V1Q9UGF6 321 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MAB21L2Q9Y586 359 aa18.48■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DENRO43583 198 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 FSHBP01225 129 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SRD5A1P18405 259 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ADRA2CP18825 462 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 DGUOKQ16854 277 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SLC25A26Q70HW3 274 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CD177Q8N6Q3 437 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 OR51A2Q8NGJ7 313 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SLAMF9Q96A28 289 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 ORAI1Q96D31 301 aa18.47■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RFPL4AA6NLU0 287 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SIGLEC5O15389 551 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SULT1B1O43704 296 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PLATP00750 562 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 IGKV1D-12P01611 117 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 CELP19835 753 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 HNF1AP20823 631 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R43P59537 309 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 BDH1Q02338 343 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PDZK1IP1Q13113 114 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 TMEM106AQ96A25 262 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 SDSLQ96GA7 329 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 MND1Q9BWT6 205 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 METRNQ9UJH8 293 aa18.46■□□□□ 0.55
SYF2-201ENST00000236273 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 OCM2P0CE71 109 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NPBWR2P48146 333 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 YIF1BQ5BJH7 314 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 BTN2A1Q7KYR7 527 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RFT1Q96AA3 541 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 CEP19Q96LK0 163 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 TAS2R4Q9NYW5 299 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 AUP1Q9Y679 476 aa18.45■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 RGS10O43665 173 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 INMTO95050 263 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NXPH2O95156 264 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ZP1P60852 638 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 IKZF1Q13422 519 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SPHARQ15513 63 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 SMIM21Q3B7S5 101 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 C11orf91Q3C1V1 193 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 CD276Q5ZPR3 534 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 PRSS48Q7RTY5 328 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 ZNRF1Q8ND25 227 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 LY6G5BQ8NDX9 201 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 MED30Q96HR3 178 aa18.44■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 NDUFB3O43676 98 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 GPX5O75715 221 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 PRDX2P32119 198 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 GABRA2P47869 451 aa18.43■□□□□ 0.54
SYF2-201ENST00000236273 POU3F4P49335 361 aa18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms