RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000075430.11

CTDP1-201, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 3,538 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-201ENST00000075430 HLA-GP17693 338 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CCNOP22674 350 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CYB5R2Q6BCY4 276 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 A0A1B0GTQ1 180 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CD5P06127 495 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PLA2G5P39877 138 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 NECAP1Q8NC96 275 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PECRQ9BY49 303 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 QRFPP83859 136 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HGFACQ04756 655 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SPNS3Q6ZMD2 512 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LIPHQ8WWY8 451 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZDHHC12Q96GR4 267 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CRLF2Q9HC73 371 aa14.7□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HLA-HP01893 362 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LTBRP36941 435 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RSU1Q15404 277 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SLC39A7Q92504 469 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HOXB13Q92826 284 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 POM121Q96HA1 1249 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF576Q9H609 170 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 A6NIZ1 184 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZFP92A6NM28 416 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF724A8MTY0 619 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SNCAP37840 140 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RAP1BP61224 184 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PYY3Q5JQD4 70 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DTX1Q86Y01 620 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UBALD1Q8TB05 177 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 FAHD2AQ96GK7 314 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 KCNK17Q96T54 332 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SDHAF3Q9NRP4 125 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DOK5Q9P104 306 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SSSCA1O60232 199 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF728P0DKX0 622 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DUSP1P28562 367 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PPA1Q15181 289 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IZUMO4Q1ZYL8 232 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RNF212Q495C1 297 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SLC22A25Q6T423 547 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR1L3Q8NH93 324 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HSF4Q9ULV5 492 aa14.69□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MASP2O00187 686 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TRGC2P03986 189 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RNASE11Q8TAA1 199 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OCSTAMPQ9BR26 566 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 WDFY4Q6ZS81 3184 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 MMP9P14780 707 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35A1P78382 337 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UBE2V2Q15819 145 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SSX9Q7RTT3 188 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR1J1Q8NGS3 322 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 LIME1Q9H400 295 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF442Q9H7R0 627 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SRPK3Q9UPE1 567 aa14.68□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UBE2CO00762 179 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGHV3-9P01782 118 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TAS2R46P59540 309 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PIGYQ3MUY2 71 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 C9orf135Q5VTT2 229 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 IGHG1P01857 330 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CHATP28329 748 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 C10orf91Q5T1B1 145 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TMEM268Q5VZI3 342 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PARP11Q9NR21 331 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 CEP250Q9BV73 2442 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 PHOX2AO14813 284 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TSPAN2O60636 221 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 HEXBP07686 556 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 GNRHRP30968 328 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 RPS23P62266 143 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 STX12Q86Y82 276 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR10G3Q8NGC4 313 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SLC35B3Q9H1N7 401 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TMPRSS5Q9H3S3 457 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 SMOC1Q9H4F8 434 aa14.67□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 DOCK10Q96BY6 2186 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 TRBV6-7A0A0A0MS04 114 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 WRBO00258 174 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 EFNA2O43921 213 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 OR2J2O76002 312 aa14.66□□□□□ -0.06
CTDP1-201ENST00000075430 ISG15P05161 165 aa14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.3 ms