RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000630659.2

BBS1-225, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 5 BASIC

Gene BBS1, Length 1,934 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-225	ENST00000630659	NKX6-1	P78426	367 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CLINT1	Q14677	625 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PLPPR5	Q32ZL2	321 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF529	Q6P280	563 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DDIT4L	Q96D03	193 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	C2orf50	Q96LR7	162 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	WDR76	Q9H967	626 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RYDEN	Q9NUL5	291 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FOXJ2	Q9P0K8	574 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	IKZF2	Q9UKS7	526 aa		13.48	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MSGN1	A6NI15	193 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CEACAM18	A8MTB9	384 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FTCDNL1	E5RQL4	147 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PLPP3	O14495	311 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	AGPAT2	O15120	278 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LDLRAD4	O15165	306 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SFT2D2	O95562	160 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	REN	P00797	406 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TRIP6	Q15654	476 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MEST	Q5EB52	335 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HES3	Q5TGS1	186 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LRRC18	Q8N456	261 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FADS6	Q8N9I5	356 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TERB2	Q8NHR7	220 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MASP2	O00187	686 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PSMD9	O00233	223 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SPARC	P09486	303 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SEC11B	P0C7V7	166 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	AKR1C4	P17516	323 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	FGF7	P21781	194 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GAMT	Q14353	236 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TGIF1	Q15583	401 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SLC22A25	Q6T423	547 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CLEC9A	Q6UXN8	241 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HOGA1	Q86XE5	327 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	POC1B	Q8TC44	478 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	NDUFAF3	Q9BU61	184 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PARD6A	Q9NPB6	346 aa		13.47	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659		A0A1W2PPE2	198 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SHISA8	B8ZZ34	492 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	GPANK1	O95872	356 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	LIPC	P11150	499 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RPL27	P61353	136 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	DPPA2	Q7Z7J5	298 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM156	Q8N614	296 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF511	Q8NB15	262 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	RELT	Q969Z4	430 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MRGPRF	Q96AM1	343 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF775	Q96BV0	537 aa	Predicted RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	MUCL1	Q96DR8	90 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	ANGPTL4	Q9BY76	406 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CNTNAP3	Q9BZ76	1288 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	EIF5A2	Q9GZV4	153 aa	Known RBP	13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	TXNIP	Q9H3M7	391 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	PTGES2	Q9H7Z7	377 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	SERINC1	Q9NRX5	453 aa		13.46	□□□□□ -0.25
BBS1-225	ENST00000630659	CPAMD8	Q8IZJ3	1885 aa		13.46	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF724	A8MTY0	619 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659		H7C1C5	153 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659		H7C1Q1	480 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	XKRY	O14609	159 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	EFNA2	O43921	213 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	IGHM	P01871	453 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ARG1	P05089	322 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	LSM6	P62312	80 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	LCN6	P62502	163 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ZP4	Q12836	540 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	SURF2	Q15527	256 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ACKR1	Q16570	336 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	MOGAT2	Q3SYC2	334 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ANKRD39	Q53RE8	183 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TMEM225	Q6GV28	225 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TRAPPC6B	Q86SZ2	158 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	FJX1	Q86VR8	437 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	GPR87	Q9BY21	358 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	SRA1	Q9HD15	236 aa	Known RBP	13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	RAB22A	Q9UL26	194 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	DHDH	Q9UQ10	334 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	ZNF318	Q5VUA4	2279 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CACNA1H	O95180	2353 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	SDK2	Q58EX2	2172 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	PRR33	A8MZF0	331 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	KCNAB3	O43448	404 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CSN2	P05814	226 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	DANCR	P0C864	163 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	CCL3	P10147	92 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	COX5B	P10606	129 aa		13.45	□□□□□ -0.26
BBS1-225	ENST00000630659	IL11	P20809	199 aa		13.45	□□□□□ -0.26

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