RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613916.1

PVT1-222, Transcript of Pvt1 oncogene, human

Gene PVT1, Length 137 nt, Biotype misc RNA, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PVT1-222	ENST00000613916	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MPC1	Q9Y5U8	109 aa		6.26	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	6.26	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		A0A1B0GWJ7	208 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MEIOC	A2RUB1	952 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	DPRX	A6NFQ7	191 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FOXI3	A8MTJ6	420 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ATP6V1G2-DDX39B	F2Z307	99 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MLNR	O43193	412 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SPRY1	O43609	319 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ANGPTL7	O43827	346 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SSX4	O60224	188 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CDC14B	O60729	498 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MPIG6B	O95866	241 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	UBB	P0CG47	229 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CD99	P14209	185 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF250	P15622	560 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SPN	P16150	400 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	AGA	P20933	346 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CA6	P23280	308 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CD40	P25942	277 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RFX2	P48378	723 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ATP1B3	P54709	279 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ASAH1	Q13510	395 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	DAZAP2	Q15038	168 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	OXA1L	Q15070	435 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM69	Q5SWH9	247 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MBNL2	Q5VZF2	373 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ALKBH2	Q6NS38	261 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MTFR2	Q6P444	385 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		Q6ZR03	302 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	DCDC5	Q6ZRR9	648 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	WDR86	Q86TI4	376 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ZDHHC23	Q8IYP9	409 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CENPS	Q8N2Z9	138 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PNLDC1	Q8NA58	520 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		Q8NFD4	153 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PXT1	Q8NFP0	134 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	OR5A2	Q8NGI9	324 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	OR10K1	Q8NGX5	313 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	OR52I2	Q8NH67	350 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	KCNG3	Q8TAE7	436 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FAM46B	Q96A09	425 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	WFIKKN1	Q96NZ8	548 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GAL3ST1	Q99999	423 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	THAP7	Q9BT49	309 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TM2D1	Q9BX74	207 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	BANF2	Q9H503	90 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	DIABLO	Q9NR28	239 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MRPL15	Q9P015	296 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GHRL	Q9UBU3	117 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PURG	Q9UJV8	347 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ELF5	Q9UKW6	265 aa	Predicted RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FZR1	Q9UM11	496 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ING4	Q9UNL4	249 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MRPS7	Q9Y2R9	242 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RBMX2	Q9Y388	322 aa	Known RBP	6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	DOCK11	Q5JSL3	2073 aa		6.25	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TRAV18	A0A075B6X5	111 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		A0A0A6YYH2	397 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		A6NJ64	397 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FAM90A27P	A6NNH2	459 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ANKRD30BL	A7E2S9	258 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF732	B4DXR9	585 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916		H0YL77	283 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GABARAP	H6UMI1	98 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	C19orf84	I3L1E1	186 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SOCS1	O15524	211 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ORC5	O43913	435 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PLAT	P00750	562 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CRYAA	P02489	173 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	CD3G	P09693	182 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM225B	P0DP42	221 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PPP3CB	P16298	524 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	MGMT	P16455	207 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SELE	P16581	610 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GLRX	P35754	106 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	VEGFC	P49767	419 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	FABP6	P51161	128 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GPM6A	P51674	278 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TMEM50B	P56557	158 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RPS27A	P62979	156 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	PITPNA	Q00169	270 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	GUCA2A	Q02747	115 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	TFF3	Q07654	80 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SCN1B	Q07699	218 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	SNTB2	Q13425	540 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	RGS21	Q2M5E4	152 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PVT1-222	ENST00000613916	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		6.24	□□□□□ -1.41

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms