RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590608.1

ATP9B-223, Transcript of ATPase phospholipid transporting 9B (putative), human

TSL 3

Gene ATP9B, Length 594 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4M2	Q8NGB6	313 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	OR1L1	Q8NH94	360 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ENKUR	Q8TC29	256 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	C22orf15	Q8WYQ4	148 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	HGD	Q93099	445 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	ZMYND19	Q96E35	227 aa	Predicted RBP	3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	VCX	Q9H320	206 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	C12orf4	Q9NQ89	552 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	CA10	Q9NS85	328 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	EURL	Q9NYK6	297 aa		3.09	□□□□□ -1.91
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV7-4-1	A0A0J9YVY3	117 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	KIR2DS1	A0A191URI9	304 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CALU	O43852	315 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CCNK	O75909	580 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	IGKV5-2	P06315	115 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	PCK1	P35558	622 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	PSMB2	P49721	201 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ACOT2	P49753	483 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	MNAT1	P51948	309 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR10A3	P58181	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ADIG	Q0VDE8	80 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SLAMF1	Q13291	335 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	BSX	Q3C1V8	233 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ACTBL2	Q562R1	376 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TEX30	Q5JUR7	227 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	HBM	Q6B0K9	141 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LRRC6	Q86X45	466 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF695	Q8IW36	515 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CD302	Q8IX05	232 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	FAM9C	Q8IZT9	166 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00337	Q8N6G1	96 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR5T1	Q8NG75	326 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4K2	Q8NGD2	314 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SFXN5	Q8TD22	340 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SMARCD1	Q96GM5	515 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF285	Q96NJ3	590 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SPACA5	Q96QH8	159 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	FBXO6	Q9NRD1	293 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	NLE1	Q9NVX2	485 aa	Predicted RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	C15orf41	Q9Y2V0	281 aa		3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	YTHDF2	Q9Y5A9	579 aa	Known RBP	3.08	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TMEM131	Q92545	1883 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LOC102724200	A0A096LPH7	203 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RBFOX3	A6NFN3	312 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	PLPP3	O14495	311 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TOR1A	O14656	332 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	YEATS4	O95619	227 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RLN2	P04090	185 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	M6PR	P20645	277 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TGFBR1	P36897	503 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OPRK1	P41145	380 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CXCL12	P48061	93 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	XK	P51811	444 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4D1	Q15615	310 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TRIP13	Q15645	432 aa	Predicted RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2S	Q16763	222 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CEACAM16	Q2WEN9	425 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	C5orf47	Q569G3	176 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	NANOGP8	Q6NSW7	305 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	GUSBP11	Q6P575	273 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	BBS7	Q8IWZ6	715 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608		Q8N9L7	120 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC01560	Q8TB33	94 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RNASEH2C	Q8TDP1	164 aa	Known RBP	3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SNF8	Q96H20	258 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	SMIM8	Q96KF7	97 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	MARVELD1	Q9BSK0	173 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	DOCK9	Q9BZ29	2069 aa		3.07	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	IGLV3-16	A0A075B6K0	115 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	IGHV3-49	A0A0A0MS15	119 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	MKRN2OS	H3BPM6	223 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	GATB	O75879	557 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	VAMP5	O95183	116 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00869	P0C866	280 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	KDELR2	P33947	212 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	NOV	P48745	357 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB38	P57729	211 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	UBE2G2	P60604	165 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RPL10A	P62906	217 aa	Known RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	RAB31	Q13636	194 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	FLOT2	Q14254	428 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TOMM34	Q15785	309 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	LINC00483	Q53H64	154 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	YIF1B	Q5BJH7	314 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	IDNK	Q5T6J7	187 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608		Q5W150	140 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR2M7	Q8NG81	312 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR4K17	Q8NGC6	315 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	OR51Q1	Q8NH59	317 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	ZNF420	Q8TAQ5	688 aa	Predicted RBP	3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	BLNK	Q8WV28	456 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	TNFRSF14	Q92956	283 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	CCDC127	Q96BQ5	260 aa		3.06	□□□□□ -1.92
ATP9B-223	ENST00000590608	L3HYPDH	Q96EM0	354 aa		3.06	□□□□□ -1.92

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48 ms