RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 PNPLA2Q96AD5 504 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 CST11Q9H112 138 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 RPS10P5Q9NQ39 176 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 SMCO4Q9NRQ5 59 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 SVILO95425 2214 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 ZNF208O43345 1280 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 TAS2R19P59542 299 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 DHRS2Q13268 280 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 PDCD1Q15116 288 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 C9orf135Q5VTT2 229 aa13.23□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 ROBO4Q8WZ75 1007 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 MRGPRFQ96AM1 343 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 C2orf88Q9BSF0 95 aa13.23□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 C13orf42A0A1B0GVH6 325 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 OR2AT4A6NND4 320 aa13.23□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 DNM1P46Q6ZS02 220 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 FOXRED2Q8IWF2 684 aa13.23□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 OR5D14Q8NGL3 314 aa13.23□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 NPY4RP50391 375 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 PPP1R1AQ13522 171 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 THEM4Q5T1C6 240 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 C1orf185Q5T7R7 199 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 UNQ6126/PRO20091Q6UXV3 157 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 MARCH1Q8TCQ1 289 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 FOLR2P14207 255 aa13.22□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 ACTBP60709 375 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 ACTG1P63261 375 aa13.22□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 SERPINA2P20848 420 aa13.21□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 TMPPEQ6ZT21 453 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 OIT3Q8WWZ8 545 aa13.21□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 RNF122Q9H9V4 155 aa13.21□□□□□ -0.29
CTIF-205ENST00000587860 UQCC1Q9NVA1 299 aa13.21□□□□□ -0.29
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CTIF-205ENST00000587860 IGHV1-45A0A0A0MS14 117 aa13.21□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 NSG1A0A0A6YYJ2 146 aa13.2□□□□□ -0.3
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CTIF-205ENST00000587860 ZIC3O60481 467 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ITGB2P05107 769 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 IL5P05113 134 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 CPN1P15169 458 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RAB5CP51148 216 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 LSM6P62312 80 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 ETFRF1Q6IPR1 90 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 SLC22A24Q8N4F4 322 aa13.2□□□□□ -0.3
CTIF-205ENST00000587860 OXGR1Q96P68 337 aa13.2□□□□□ -0.3
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