RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000586851.5

CAPNS1-202, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 616 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-202ENST00000586851 ARHGDIBP52566 201 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 HERV-K104P61576 105 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FMODQ06828 376 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF616Q08AN1 781 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FOXF1Q12946 379 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MYBPHQ13203 477 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PMS2P11Q13670 270 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB30Q15771 203 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SMAD2Q15796 467 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 C9orf50Q5SZB4 431 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RHBDD2Q6NTF9 364 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXW12Q6X9E4 464 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SYT13Q7L8C5 426 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF321PQ8N8H1 164 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 CLEC18CQ8NCF0 446 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM104Q8NE00 496 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 OR51F2Q8NH61 342 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RTN4IP1Q8WWV3 396 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MOB3AQ96BX8 217 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 C18orf12Q96KH6 178 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 CLCC1Q96S66 551 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 TCEAL2Q9H3H9 227 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 RIMS4Q9H426 269 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PLEKHF2Q9H8W4 249 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PNRC2Q9NPJ4 139 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 PARPBPQ9NWS1 579 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 KLRF1Q9NZS2 232 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GAT1Q9P2W7 334 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 NXT1Q9UKK6 140 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.78□□□□□ -1.32
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF732B4DXR9 585 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 H3BSH0 61 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 K7N7A8 449 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PIAS2O75928 621 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 OR2C1O95371 312 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 DIRAS3O95661 229 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 KNG1P01042 644 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 IFNA1P01562 189 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV2-70P01814 119 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8U9P0C7N5 309 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 HLA-DOBP13765 273 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PNLIPP16233 465 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF17P17021 662 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 HOXA5P20719 270 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 ACKR3P25106 362 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 NFYBP25208 207 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 LBX1P52954 281 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PIGPP57054 158 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 FBXW4P57775 412 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB4BP61018 213 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PCBD1P61457 104 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 HGFACQ04756 655 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SQSTM1Q13501 440 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM187Q14656 261 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 RAB35Q15286 201 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 NRN1LQ496H8 165 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 KHDC3LQ587J8 217 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM92Q6UXU6 159 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 HEPN1Q6WQI6 88 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM57BQ71RH2 274 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 LINC00596Q86U02 117 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 OR8U1Q8NH10 309 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 NANPQ8TBE9 248 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 LMX1AQ8TE12 382 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 C2CD4CQ8TF44 421 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SECTM1Q8WVN6 248 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM54Q969K7 222 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 FAM71F1Q96KD3 344 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 P2RX4Q99571 388 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 SSX3Q99909 188 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 NIPSNAP3BQ9BS92 247 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 RSRP1Q9BUV0 290 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 RTN4RQ9BZR6 473 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 CTDSP1Q9GZU7 261 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 METTL7AQ9H8H3 244 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 MED29Q9NX70 200 aa6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 GAR1Q9NY12 217 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 PCNTO95613 3336 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 A0A1W2PR77 199 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 RBFOX3A6NFN3 312 aa6.76□□□□□ -1.33
CAPNS1-202ENST00000586851 ZNF850A8MQ14 1090 aa6.76□□□□□ -1.33
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