RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572369.5

SMG6-211, Transcript of SMG6, nonsense mediated mRNA decay factor, humanhuman

TSL 3

Gene SMG6, Length 689 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG6-211ENST00000572369 C10orf35Q96D05 121 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCL13Q99616 98 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR51I2Q9H344 312 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OCEL1Q9H607 264 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NEK6Q9HC98 313 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SCN3BQ9NY72 215 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 METRNQ9UJH8 293 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 DHDHQ9UQ10 334 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 AUP1Q9Y679 476 aa6.49□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ARHGAP32A7KAX9 2087 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PQLC2LA1A4F0 135 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 A8MXK9 166 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PTGES3LE9PB15 166 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 H0YJX3 145 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 J3QT63 122 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 DVL1O14640 695 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ENSAO43768 121 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NXPH2O95156 264 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ATP6V1G2O95670 118 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ISG15P05161 165 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LIMS3P0CW19 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LIMS4P0CW20 117 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PRKACBP22694 351 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CFHR2P36980 270 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FUT6P51993 359 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CAPZA1P52907 286 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ATP1B3P54709 279 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 IKZF1Q13422 519 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 UBE2V2Q15819 145 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SMIM21Q3B7S5 101 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LRRC10Q5BKY1 277 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FAM76BQ5HYJ3 339 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMEM42Q69YG0 159 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 IZUMO2Q6UXV1 221 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 BATF2Q8N1L9 274 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NANPQ8TBE9 248 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GATAD2BQ8WXI9 593 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TFAP2CQ92754 450 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SEH1LQ96EE3 360 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MED30Q96HR3 178 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 JAM3Q9BX67 310 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CHST5Q9GZS9 411 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RASSF4Q9H2L5 321 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MMP26Q9NRE1 261 aa6.48□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP6.48□□□□□ -1.37
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SMG6-211ENST00000572369 CTSZQ9UBR2 303 aa6.48□□□□□ -1.37
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SMG6-211ENST00000572369 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR4C45A6NMZ5 311 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR2AT4A6NND4 320 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 E9PI62 339 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MAGEB3O15480 346 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SYNGR1O43759 233 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ZFPL1O95159 310 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CD2P06729 351 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 HCKP08631 526 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PIPP12273 146 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 NDUFB7P17568 137 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ADRA2CP18825 462 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ATF1P18846 271 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SOX2P48431 317 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TGM4P49221 684 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 POU3F4P49335 361 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RBP2P50120 134 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MTCP1P56278 107 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 IL13RA1P78552 427 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 CCDC58Q4VC31 144 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ACP7Q6ZNF0 438 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 Q6ZSR3 168 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 UTS2BQ765I0 119 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 KRT74Q7RTS7 529 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 MKXQ8IYA7 352 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 POC1AQ8NBT0 407 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 TMEM185AQ8NFB2 350 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.47□□□□□ -1.37
SMG6-211ENST00000572369 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.47□□□□□ -1.37
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