RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568936.1

CCNDBP1-214, Transcript of cyclin D1 binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CCNDBP1, Length 2,088 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNDBP1-214ENST00000568936 GON7Q9BXV9 100 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 LPAR5Q9H1C0 372 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 PIGMQ9H3S5 423 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 OBP2BQ9NPH6 170 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 KCNN3Q9UGI6 736 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF222Q9UK12 451 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 ING4Q9UNL4 249 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 OSGIN2Q9Y236 505 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.96□□□□□ -0.81
CCNDBP1-214ENST00000568936 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 RAB27BO00194 218 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 FABP7O15540 132 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 SSNA1O43805 119 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 NDUFB6O95139 128 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 IGKV1D-12P01611 117 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ALDH3B1P43353 468 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 MECP2P51608 486 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 ACTG1P63261 375 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 GUCA2AQ02747 115 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 MSMPQ1L6U9 139 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZBTB37Q5TC79 503 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 FBXW12Q6X9E4 464 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CALHM1Q8IU99 346 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR1J1Q8NGS3 322 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 GPX8Q8TED1 209 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 TNFAIP8L1Q8WVP5 186 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 MED30Q96HR3 178 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 OR10A4Q9H209 315 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 SCPEP1Q9HB40 452 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 RAB22AQ9UL26 194 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ACACBO00763 2458 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CADP27708 2225 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 MEIKINA0A087WXM9 373 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 SMLR1H3BR10 107 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CDC14BO60729 498 aa9.95□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CST4P01036 141 aa9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 RBMS2Q15434 407 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 ERVH48-1M5A8F1 160 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 MPIG6BO95866 241 aa9.94□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 CXCL3P19876 107 aa9.94□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 PPA1Q15181 289 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 RAB12Q6IQ22 244 aa9.94□□□□□ -0.82
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CCNDBP1-214ENST00000568936 BEST4Q8NFU0 473 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR5L1Q8NGL2 311 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR4C16Q8NGL9 310 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 GRPEL2Q8TAA5 225 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 KLF14Q8TD94 323 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 BORCS8Q96FH0 119 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF581Q9P0T4 197 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 FZR1Q9UM11 496 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 USP24Q9UPU5 2620 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 METTL21EPA6NDL7 271 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 J3QW42 95 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 M0R1B8 84 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 SOCS1O15524 211 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 HPXP02790 462 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 THBDP07204 575 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 GTF2F2P13984 249 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 PRKACBP22694 351 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CA6P23280 308 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 FUT6P51993 359 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 OR2W3Q7Z3T1 314 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 BEX1Q9HBH7 125 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 NPTNQ9Y639 398 aa9.94□□□□□ -0.82
CCNDBP1-214ENST00000568936 NBASA2RRP1 2371 aa9.94□□□□□ -0.82
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