RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560965.1

CHP1-208, Transcript of calcineurin like EF-hand protein 1, human

TSL 2

Gene CHP1, Length 467 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CHP1-208	ENST00000560965	CXXC4	Q9H2H0	198 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR51B6	Q9H340	312 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	BARX1	Q9HBU1	254 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DYNLRB1	Q9NP97	96 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DLL4	Q9NR61	685 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TAAR3P	Q9P1P4	343 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RSL24D1	Q9UHA3	163 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LOC100506127	A0A0U1RQW1	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LRP5L	A4QPB2	252 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC30	A6NM36	301 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF850	A8MQ14	1090 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PYCARD-AS1	I3L0S3	204 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	AIP	O00170	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SCGN	O76038	276 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	HCK	P08631	526 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RAB3B	P20337	219 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SOX6	P35712	828 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF93	P35789	620 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RORC	P51449	518 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MTCP1	P56278	107 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DSCR9	P59020	149 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ERVS71-1	P61550	626 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IL24	Q13007	206 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PRDX4	Q13162	271 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SNTB1	Q13884	538 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	KISS1	Q15726	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	UBE2V2	Q15819	145 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MST1L	Q2TV78	715 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SPATA46	Q5T0L3	261 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PLCXD3	Q63HM9	321 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FIP1L1	Q6UN15	594 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SLC16A12	Q6ZSM3	486 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LINC00596	Q86U02	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FAM90A1	Q86YD7	464 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CLVS1	Q8IUQ0	354 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MKX	Q8IYA7	352 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LRRC75A-AS1	Q8N1F1	130 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PXT1	Q8NFP0	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IGFBPL1	Q8WX77	278 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ACOT12	Q8WYK0	555 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PIGC	Q92535	297 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TMEM203	Q969S6	136 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PTX4	Q96A99	478 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SLC25A46	Q96AG3	418 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	C12orf43	Q96C57	262 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ISOC1	Q96CN7	298 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ELMOD3	Q96FG2	381 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TRMT61A	Q96FX7	289 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	S100A13	Q99584	98 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SYT3	Q9BQG1	590 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RBM38	Q9H0Z9	239 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CST11	Q9H112	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	OR51E2	Q9H255	320 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	POFUT1	Q9H488	388 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SAP30L	Q9HAJ7	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DECR2	Q9NUI1	292 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RASL12	Q9NYN1	266 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IL36G	Q9NZH8	169 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RABL2A	Q9UBK7	228 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	FBLN5	Q9UBX5	448 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RABL2B	Q9UNT1	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	RHBDD3	Q9Y3P4	386 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NPTN	Q9Y639	398 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CEPT1	Q9Y6K0	416 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	A3GALT2	U3KPV4	340 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		V9GY05	133 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	LRBA	P50851	2863 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CENPE	Q02224	2701 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	DYSF	O75923	2080 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CACNA1D	Q01668	2161 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	UTP20	O75691	2785 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		A1L4Q6	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IFITM5	A6NNB3	132 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		H3BMQ9	156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965		J3QT63	122 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	NDUFS8	O00217	210 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	SLC17A2	O00624	439 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PIN1P1	O15428	100 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	MLNR	O43193	412 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	TPPP	O94811	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	PLAU	P00749	431 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	CD8A	P01732	235 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CHP1-208	ENST00000560965	IGHV1-46	P01743	117 aa		4.87	□□□□□ -1.63

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