RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-222ENST00000550996 OR10AC1Q8NH08 325 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ZNF671Q8TAW3 534 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 FAM216AQ8WUB2 273 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 TMIGD2Q96BF3 282 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 C4orf36Q96KX1 117 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 JMJD8Q96S16 334 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 MAB21L2Q9Y586 359 aa17.22■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 NKX6-3A6NJ46 265 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 SNTNA6NMZ2 147 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 J3QLW9 94 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 NDUFB3O43676 98 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 MPZL2O60487 215 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 CLIC3O95833 236 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ZNF19P17023 458 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 MPZP25189 248 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 PEX2P28328 305 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 IL13RA1P78552 427 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 SMN1Q16637 294 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ACP7Q6ZNF0 438 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 KCTD20Q7Z5Y7 419 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 BATF2Q8N1L9 274 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 RDH12Q96NR8 316 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 NRIP2Q9BQI9 281 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 DCTN5Q9BTE1 182 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 CHST5Q9GZS9 411 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 PLEKHA1Q9HB21 404 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 PCDHGB1Q9Y5G3 927 aa17.21■□□□□ 0.35
CS-222ENST00000550996 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 OR4C45A6NMZ5 311 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 TRIM77I1YAP6 450 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 GABRA2P47869 451 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 GALEQ14376 348 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 LRRC10Q5BKY1 277 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CD177Q8N6Q3 437 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ZNRF1Q8ND25 227 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 OR52I1Q8NGK6 324 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 C8orf46Q8TAG6 207 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 Q96MT0 163 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ALG8Q9BVK2 526 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CNTD2Q9H8S5 307 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 HES4Q9HCC6 221 aa17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP17.2■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 E9PI62 339 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ERVK11-1P61568 191 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 GPR157Q5UAW9 335 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 METTL11BQ5VVY1 283 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CCDC54Q8NEL0 328 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 OR51A4Q8NGJ6 313 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 SDSLQ96GA7 329 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 MED30Q96HR3 178 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ADI1Q9BV57 179 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ERVK13-1Q9NX77 482 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 RASL12Q9NYN1 266 aa17.19■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 RFPL4AA6NLU0 287 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 F8VVB4 439 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 F8VWA3 439 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 GPR37O15354 613 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ISG15P05161 165 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 HTR1AP08908 422 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CCR9P51686 369 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 DLX1P56177 255 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CAV3P56539 151 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ACTA2P62736 377 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ACTG2P63267 376 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 RAB40BQ12829 278 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 DEFB112Q30KQ8 113 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 SMIM21Q3B7S5 101 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ZNF691Q5VV52 312 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 TMEM244Q5VVB8 128 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 Q8N7P7 452 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 CNIH3Q8TBE1 160 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 PKIBQ9C010 78 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ONECUT1Q9UBC0 465 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 KPTNQ9Y664 436 aa17.18■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 FADS2O95864 444 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 PRTN3P24158 256 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ACTG1P63261 375 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 BAMBIQ13145 260 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 SLC9A3R2Q15599 337 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 VMO1Q7Z5L0 202 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 SYS1Q8N2H4 156 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 ZNF555Q8NEP9 628 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 LHX4Q969G2 390 aa17.17■□□□□ 0.34
CS-222ENST00000550996 FGGYQ96C11 551 aa17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.1 ms