RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550857.5

PTPRB-209, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,839 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-209ENST00000550857 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-209ENST00000550857 ZNF696Q9H7X3 374 aa7.1□□□□□ -1.27
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PTPRB-209ENST00000550857 TSPAN15O95858 294 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 TPT1P13693 172 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 CD200P41217 278 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRB-209ENST00000550857 HTD2P86397 168 aa7.08□□□□□ -1.28
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