RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546891.5

CS-205, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 911 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-205ENST00000546891 OR5D18Q8NGL1 313 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 NPRL2Q8WTW4 380 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 PIK3IP1Q96FE7 263 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 CCDC120Q96HB5 630 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 LOXL4Q96JB6 756 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 LINC00052Q96N35 136 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 RTBDNQ9BSG5 229 aaPredicted RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 OPA3Q9H6K4 179 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 RNF122Q9H9V4 155 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 GPR35Q9HC97 309 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 DECR2Q9NUI1 292 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 P4HTMQ9NXG6 502 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 ANXA10Q9UJ72 324 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa8.53□□□□□ -1.04
CS-205ENST00000546891 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 POM121CA8CG34 1229 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 GDF9O60383 454 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SYNGR4O95473 234 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 DBHP09172 617 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 GABRR1P24046 479 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 GLP1RP43220 463 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 GFRA1P56159 465 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 PPIAP62937 165 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 PSG4Q00888 419 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 MALLQ13021 153 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 AIMP2Q13155 320 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SLC9A3R2Q15599 337 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CEACAM16Q2WEN9 425 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 WIPI1Q5MNZ9 446 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF774Q6NX45 483 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RNF144BQ7Z419 303 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 C1QL2Q7Z5L3 287 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 BAP18Q8IXM2 172 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CCDC71LQ8N9Z2 235 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 POC1AQ8NBT0 407 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FNDC9Q8TBE3 224 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RNF141Q8WVD5 230 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ARL11Q969Q4 196 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SPSB4Q96A44 273 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF286AQ9HBT8 521 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 TAS2R3Q9NYW6 316 aa8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 NOSIPQ9Y314 301 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 TTC28Q96AY4 2481 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 A0A0G2JMM0 328 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PPB8 328 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 A0A1W2PRS3 328 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 C5orf63A6NC05 138 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF724A8MTY0 619 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 KIR3DP1A8MWS1 328 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 TERTO14746 1132 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FGF16O43320 207 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 HOXD4P09016 255 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 B4GALT1P15291 398 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RPS2P15880 293 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CHATP28329 748 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 MPLP40238 635 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 UCP3P55916 312 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SUPT4H1P63272 117 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 Q0VFX4 171 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SRSF7Q16629 238 aaKnown RBP eCLIP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ELP2Q6IA86 826 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SAXO1Q8IYX7 474 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 OSR2Q8N2R0 312 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 MARC2Q969Z3 335 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SYT3Q9BQG1 590 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SUCNR1Q9BXA5 334 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 C1QTNF5Q9BXJ0 243 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 WNT5BQ9H1J7 359 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 LDAHQ9H6V9 325 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 BARX1Q9HBU1 254 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 LRFN1Q9P244 771 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CACNA1CQ13936 2221 aa8.51□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF587BE7ETH6 402 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 PDCD6O75340 191 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FCGR3AP08637 254 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ZNF728P0DKX0 622 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 OR5H8P0DN80 308 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ANOS1P23352 680 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 ACKR3P25106 362 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 CLDN15P56746 228 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 RPS18P62269 152 aaKnown RBP8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 SRPXP78539 464 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FAM3AP98173 230 aa8.5□□□□□ -1.05
CS-205ENST00000546891 FOXO1Q12778 655 aa8.5□□□□□ -1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.4 ms