RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546621.5

CS-204, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-204ENST00000546621 SMAD5Q99717 465 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ADAT1Q9BUB4 502 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 MFFQ9GZY8 342 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TREM1Q9NP99 234 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 DEPPQ9NTK1 212 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TMEM100Q9NV29 134 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ABRACLQ9P1F3 81 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 AK6Q9Y3D8 172 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 LRP12Q9Y561 859 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PCNX2A6NKB5 2137 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 A0A0J9YW62 118 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ANKRD61A6NGH8 418 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ZNF726A6NNF4 738 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 MFNGO00587 321 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 DVL1O14640 695 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TNFSF11O14788 317 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 DNPH1O43598 174 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 NEURL1O76050 574 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 WNT11O96014 354 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 RFPL3SP0C7P2 107 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ATF1P18846 271 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 ELK1P19419 428 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 EPHA1P21709 976 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 CPT2P23786 658 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 CLDN17P56750 224 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 RAB1AP62820 205 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 HGFACQ04756 655 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PJVKQ0ZLH3 352 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 HIST3H3Q16695 136 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 KRTCAP3Q53RY4 240 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 NCMAPQ5T1S8 102 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 CARD17Q5XLA6 110 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SPINK14Q6IE38 97 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SLC25A47Q6Q0C1 308 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SYT9Q86SS6 491 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 CD163Q86VB7 1156 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TMPRSS12Q86WS5 348 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 LINC00346Q8IVM7 164 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SAMD12Q8N8I0 201 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 RELL2Q8NC24 303 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PRSS33Q8NF86 280 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 GPR148Q8TDV2 347 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 THRSPQ92748 146 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 MCHR2Q969V1 340 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 FBXO17Q96EF6 278 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 FAM173AQ9BQD7 235 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SUCNR1Q9BXA5 334 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SLITRK2Q9H156 845 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 SLC25A18Q9H1K4 315 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PLEKHA1Q9HB21 404 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 PUS1Q9Y606 427 aaKnown RBP eCLIP6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 KPTNQ9Y664 436 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 R4GMQ9 66 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 FREM3P0C091 2139 aa6.84□□□□□ -1.31
CS-204ENST00000546621 CACNA1HO95180 2353 aa6.84□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 DOCK10Q96BY6 2186 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 UBE2QL1A1L167 161 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 PINLYPA6NC86 204 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 OR5H15A6NDH6 313 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 OR5H1A6NKK0 313 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 AHRRA9YTQ3 701 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 NPIPA2E9PIF3 369 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 F5H5P2 479 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 NPIPA3F8WFD2 350 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 TMEM127O75204 238 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ACTL6AO96019 429 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 PNPP00491 289 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ZNF16P17020 682 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 NFYBP25208 207 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 GDF1P27539 372 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 SOX2P48431 317 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RAC3P60763 192 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 MADCAM1Q13477 382 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RHEBQ15382 184 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 OR1C1Q15619 314 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 ODF4Q2M2E3 257 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 OR10K2Q6IF99 312 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 RAB12Q6IQ22 244 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-204ENST00000546621 Q6ZTK2 550 aa6.83□□□□□ -1.32
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