RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000544675.1

NDUFA9-208, Transcript of NADH:ubiquinone oxidoreductase subunit A9, human

TSL 4

Gene NDUFA9, Length 857 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NDUFA9-208	ENST00000544675	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.98	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MIA3	Q5JRA6	1907 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TTC3	P53804	2025 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MYO18A	Q92614	2054 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRIP11	Q15643	1979 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	LOC285556	D6RIA3	1793 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRAV1-2	A0A0B4J238	106 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675		A0A1W2PPE2	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	NKX2-6	A6NCS4	301 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RNF212B	A8MTL3	300 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	SUPT3H	B4E1H0	165 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675		M0QZ24	198 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAAH	O00519	579 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	KLK8	O60259	260 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MTX2	O75431	263 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	PMS2P2	O95744	297 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TRGC2	P03986	189 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	CXCL1	P09341	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	CSF1	P09603	554 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RFPL3S	P0C7P2	107 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	LINC00032	P0C843	101 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	PPIAL4G	P0DN37	164 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	F3	P13726	295 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	IGFBP2	P18065	325 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	GPX2	P18283	190 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	THBS3	P49746	956 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	BID	P55957	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	ST3GAL3	Q11203	375 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	AIMP2	Q13155	320 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	GINS1	Q14691	196 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TGIF1	Q15583	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RBBP7	Q16576	425 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM249	Q2WGJ8	235 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MIDN	Q504T8	468 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	EIPR1	Q53HC9	387 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	REEP3	Q6NUK4	255 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	FAM71F2	Q6NXP2	309 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	CEACAM20	Q6UY09	585 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675		Q6ZSR9	355 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMPPE	Q6ZT21	453 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	COMMD6	Q7Z4G1	85 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	ADCK2	Q7Z695	626 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMPRSS11B	Q86T26	416 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	NR2C2AP	Q86WQ0	139 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	ARHGAP12	Q8IWW6	846 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	BEST3	Q8N1M1	668 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MUC20	Q8N307	709 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	C17orf78	Q8N4C9	275 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	STPG4	Q8N801	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	SIDT2	Q8NBJ9	832 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675		Q8WTZ3	238 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	SECTM1	Q8WVN6	248 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM239	Q8WW34	195 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	NPIPB3	Q92617	1050 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RAB1C	Q92928	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MS4A6E	Q96DS6	147 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	IL4I1	Q96RQ9	567 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	PYGO2	Q9BRQ0	406 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	METTL7A	Q9H8H3	244 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	BEX1	Q9HBH7	125 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MBNL1	Q9NR56	388 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	HIF1AN	Q9NWT6	349 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RAB22A	Q9UL26	194 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	YARS2	Q9Y2Z4	477 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RNF115	Q9Y4L5	304 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RAI2	Q9Y5P3	530 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	RELN	P78509	3460 aa		4.97	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.96	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.61
NDUFA9-208	ENST00000544675	LAMA5	O15230	3695 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	C17orf105	B2RV13	164 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675		B9A039	149 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675		E7EQ34	232 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675		M0R036	132 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	PEX12	O00623	359 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	SOCS6	O14544	535 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	TAAR5	O14804	337 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	SLC16A5	O15375	505 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	NKX2-8	O15522	239 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	OR1I1	O60431	355 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	SCGN	O76038	276 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	KCNK5	O95279	499 aa		4.96	□□□□□ -1.62
NDUFA9-208	ENST00000544675	BRI3	O95415	125 aa		4.96	□□□□□ -1.62

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