RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533451.1

UBASH3B-208, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 2

Gene UBASH3B, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2G6Q5TZ20 316 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TEX36Q5VZQ5 186 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CD276Q5ZPR3 534 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 AHSA2Q719I0 299 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 STX19Q8N4C7 294 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 BPIFB2Q8N4F0 458 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR10AC1Q8NH08 325 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 NRG4Q8WWG1 115 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 RAB40AQ8WXH6 277 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 AQP3Q92482 292 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FGGYQ96C11 551 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 BORCS8Q96FH0 119 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM80Q96HE8 168 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CHST5Q9GZS9 411 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 NLKQ9UBE8 527 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DIMT1Q9UNQ2 313 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 EXOSC1Q9Y3B2 195 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 INSIG2Q9Y5U4 225 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa9.55□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ATRQ13535 2644 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 IGHV3OR16-10A0A075B7F0 116 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 A0A1B0GW55 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 EFCAB10A6NFE3 127 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM212A6NML5 194 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR2AT4A6NND4 320 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 E9PI62 339 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 MYL12BO14950 172 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SYNGR1O43759 233 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L2P0CJ85 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L3P0CJ86 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L4P0CJ87 422 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L5P0CJ88 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L6P0CJ89 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L7P0CJ90 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 LIMS3P0CW19 117 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 LIMS4P0CW20 117 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 NDUFB7P17568 137 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 NPY4RP50391 375 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CCR9P51686 369 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ST3GAL4Q11206 333 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM42Q69YG0 159 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FDX2Q6P4F2 183 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 IZUMO2Q6UXV1 221 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 C1QL2Q7Z5L3 287 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR51A4Q8NGJ6 313 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR13C9Q8NGT0 318 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 C22orf15Q8WYQ4 148 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 PP6455Q8WZ26 134 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 PCGF1Q9BSM1 259 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 NEK6Q9HC98 313 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SMURF1Q9HCE7 757 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 MRPS18AQ9NVS2 196 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DUX4Q9UBX2 424 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 DHDHQ9UQ10 334 aa9.54□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 PPIAL4CA0A0B4J2A2 164 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 RNF212BA8MTL3 300 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 C22orf46C9J442 243 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ZFPL1O95159 310 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CYB5AP00167 134 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 HCKP08631 526 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SELLP14151 372 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CFHR2P36980 270 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SOX2P48431 317 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FUT6P51993 359 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ATP1B3P54709 279 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 MTCP1P56278 107 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FGF12P61328 243 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 IL13RA1P78552 427 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 UBE2V2Q15819 145 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CALHM1Q8IU99 346 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 FGFRL1Q8N441 504 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 GATAD2BQ8WXI9 593 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TFAP2CQ92754 450 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 GGHQ92820 318 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 SLAMF9Q96A28 289 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
UBASH3B-208ENST00000533451 TRAV40A0A0B4J280 105 aa9.52□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms