RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532751.1

PTPRK-222, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

TSL 4

Gene PTPRK, Length 563 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-222ENST00000532751 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
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PTPRK-222ENST00000532751 LAIR2Q6ISS4 152 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTPRK-222ENST00000532751 UTS2BQ765I0 119 aa18.27■□□□□ 0.52
PTPRK-222ENST00000532751 C1QL2Q7Z5L3 287 aa18.27■□□□□ 0.52
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PTPRK-222ENST00000532751 ZNF788Q6ZQV5 615 aa18.24■□□□□ 0.51
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PTPRK-222ENST00000532751 IL13RA1P78552 427 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRK-222ENST00000532751 SERPINA12Q8IW75 414 aa18.23■□□□□ 0.51
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PTPRK-222ENST00000532751 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZNF488Q96MN9 340 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 OPALINQ96PE5 141 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 ANKRD60Q9BZ19 345 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa18.23■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 SVEP1Q4LDE5 3571 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 C22orf46C9J442 243 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 SLC1A7O00341 560 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 OGG1O15527 345 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 CYB5AP00167 134 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 CD2P06729 351 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 PSG2P11465 335 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 MTCP1P56278 107 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 TAS2R43P59537 309 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 IKZF1Q13422 519 aa18.22■□□□□ 0.51
PTPRK-222ENST00000532751 BTN2A1Q7KYR7 527 aa18.22■□□□□ 0.51
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