RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 ADAM20O43506 726 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DENRO43583 198 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CRLF1O75462 422 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 FOXH1O75593 365 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MT-ND2P03891 347 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L2P0CJ85 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L3P0CJ86 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L4P0CJ87 422 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L5P0CJ88 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L6P0CJ89 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L7P0CJ90 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MICBQ29980 383 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CR1LQ2VPA4 569 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ESCO2Q56NI9 601 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4L9Q6RFH8 374 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 BATF2Q8N1L9 274 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 FGFRL1Q8N441 504 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PARP16Q8N5Y8 322 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 OR13C5Q8NGS8 318 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 OR13C9Q8NGT0 318 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 GPR148Q8TDV2 347 aa7.23□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 ORAI1Q96D31 301 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 BORCS8Q96FH0 119 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PGLYRP3Q96LB9 341 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 TECTBQ96PL2 329 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 SPACA5Q96QH8 159 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 OR5M11Q96RB7 305 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 OR8B2Q96RD0 313 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CCL13Q99616 98 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM160Q9NX00 188 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DUX4Q9UBX2 424 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DHDHQ9UQ10 334 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ERGIC3Q9Y282 383 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF281Q9Y2X9 895 aa7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 POLR3KQ9Y2Y1 108 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 LSM2Q9Y333 95 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CUBNO60494 3623 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 A8MXK9 166 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 F8VVB4 439 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 TMPRSS2O15393 492 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 NDUFA2O43678 99 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 INMTO95050 263 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PLATP00750 562 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 AVPP01185 164 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 RPSAP08865 295 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PGA5P0DJD9 388 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CELP19835 753 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 CPT2P23786 658 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 ATP1B3P54709 279 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MTCP1P56278 107 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 GNB2P62879 340 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PAX2Q02962 417 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ACSM1Q08AH1 577 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 IL24Q13007 206 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 SPHARQ15513 63 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 KCNJ8Q15842 424 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 STUMQ69YW2 141 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF529Q6P280 563 aa7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 ACP7Q6ZNF0 438 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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UBASH3B-205ENST00000529998 SERPINA12Q8IW75 414 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 POC1AQ8NBT0 407 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 DNAAF1Q8NEP3 725 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 OR5D14Q8NGL3 314 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 ANGPTL6Q8NI99 470 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 RFT1Q96AA3 541 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 TMIGD2Q96BF3 282 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 FAHD2AQ96GK7 314 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 OPALINQ96PE5 141 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MND1Q9BWT6 205 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 PKIBQ9C010 78 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 SMURF1Q9HCE7 757 aa7.22□□□□□ -1.25
UBASH3B-205ENST00000529998 MTCH1Q9NZJ7 389 aa7.22□□□□□ -1.25
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