RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524884.1

BBS1-206, Transcript of Bardet-Biedl syndrome 1, human

TSL 4

Gene BBS1, Length 572 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BBS1-206	ENST00000524884	GSG1	Q2KHT4	349 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	TP53I3	Q53FA7	332 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CLLU1	Q5K131	121 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LINC01590	Q5TEZ4	76 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	STPG1	Q5TH74	334 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PRAMEF20	Q5VT98	475 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LIPN	Q5VXI9	398 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LCN10	Q6JVE6	187 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	SLC25A25	Q6KCM7	469 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PWWP2B	Q6NUJ5	590 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NPSR1	Q6W5P4	371 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	STAC2	Q6ZMT1	411 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	DNM1P46	Q6ZS02	220 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	DGLUCY	Q7Z3D6	616 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CCDC36	Q8IYA8	594 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	C9orf62	Q8N4C0	152 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PRR26	Q8N8Z3	221 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LRRC75A	Q8NAA5	344 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR5T3	Q8NGG3	340 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR5M8	Q8NGP6	311 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR6N1	Q8NGY5	312 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR6N2	Q8NGY6	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR52N5	Q8NH56	324 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	MFSD8	Q8NHS3	518 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	SLC22A8	Q8TCC7	542 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	RNF128	Q8TEB7	428 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	HAS2	Q92819	552 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NAT6	Q93015	286 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GPR137	Q96N19	417 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	TSSK2	Q96PF2	358 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NMNAT3	Q96T66	252 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PRRT1	Q99946	306 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	EDEM2	Q9BV94	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GPR174	Q9BXC1	333 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF436	Q9C0F3	470 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	WWTR1	Q9GZV5	400 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	SIRPD	Q9H106	197 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ESRP2	Q9H6T0	727 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NOX4	Q9NPH5	578 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	YAE1D1	Q9NRH1	226 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	TAS2R5	Q9NYW4	299 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GHRL	Q9UBU3	117 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	MTFP1	Q9UDX5	166 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	MALT1	Q9UDY8	824 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GLS2	Q9UI32	602 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF222	Q9UK12	451 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	FBXL2	Q9UKC9	423 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PILRB	Q9UKJ0	227 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CLEC4A	Q9UMR7	237 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	MRPS2	Q9Y399	296 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CACNA1E	Q15878	2313 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	EPG5	Q9HCE0	2579 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GON4L	Q3T8J9	2241 aa		4.36	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	IGKV1D-42	A0A075B6H8	117 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	IGLV3-12	A0A075B6K2	115 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	IGLV3-32	A0A0A0MS00	114 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LINC00854	A0A1B0GVQ3	168 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LINC00862	A6NCI5	91 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GGT3P	A6NGU5	568 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	DISC1	C4P0D8	188 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NPIPA5	E9PKD4	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LGALS8	O00214	317 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ZNF593	O00488	134 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	DVL1	O14640	695 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	TSPAN2	O60636	221 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	LRP3	O75074	770 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	RP2	O75695	350 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GLS	O94925	669 aa	Predicted RBP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CYB5A	P00167	134 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	STATH	P02808	62 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	BGLAP	P02818	100 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PET100	P0DJ07	73 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GABRA1	P14867	456 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PVR	P15151	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	GIF	P27352	417 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	DPP4	P27487	766 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PRSS3	P35030	304 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	BTC	P35070	178 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CDKN1A	P38936	164 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CD79B	P40259	229 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	EIF2S3	P41091	472 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CBX5	P45973	191 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	NR0B1	P51843	470 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	TAS2R20	P59543	309 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	ERVK-25	P63136	954 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	EIF5A	P63241	154 aa	Known RBP	4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	IFITM2	Q01629	132 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	PUDP	Q08623	228 aa		4.35	□□□□□ -1.71
BBS1-206	ENST00000524884	CD300C	Q08708	224 aa		4.35	□□□□□ -1.71

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