RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517215.1

RNU6-1238P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1238, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1238P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TONSLQ96HA7 1378 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCDC7Q96M83 1385 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 APOBP04114 4563 aaKnown RBP-1.61□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FRMPD4Q14CM0 1322 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 NRCAMQ92823 1304 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMIM26A0A096LP01 95 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1W2PPE2 198 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A0A1W2PR64 198 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TMEM235A6NFC5 223 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PDZK1P1A8MUH7 402 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 F6UB75 175 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 K7EPK0 472 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 M0R1X1 148 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLPP1O14494 284 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RS1O15537 224 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TCF21O43680 179 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC25A20O43772 301 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZBTB14O43829 449 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PFKFB2O60825 505 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GMNNO75496 209 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CTSEP14091 401 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CD200P41217 278 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CA7P43166 264 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GBX2P52951 348 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC18A1P54219 525 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLTPP55058 493 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TAS2R20P59543 309 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PSMC6P62333 389 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SETQ01105 290 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MXD1Q05195 221 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRDNQ13061 729 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ARHGAP19Q14CB8 494 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAPRE2Q15555 327 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 TRIP10Q15642 601 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 KCTD21Q4G0X4 260 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HENMT1Q5T8I9 393 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HHATQ5VTY9 493 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 IYDQ6PHW0 289 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SDIM1Q6ZPB5 146 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS42Q7Z5A4 293 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 YRDCQ86U90 279 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC22A9Q8IVM8 553 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CENPLQ8N0S6 344 aaPredicted RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PUSL1Q8N0Z8 303 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DHRSXQ8N5I4 330 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OR5H2Q8NGV7 314 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FIBINQ8TAL6 211 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM57AQ8TBR7 257 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC13A3Q8WWT9 602 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RASSF5Q8WWW0 418 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OSTF1Q92882 214 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ISG20Q96AZ6 181 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MUCL1Q96DR8 90 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ADTRPQ96IZ2 230 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GCNAQ96QF7 691 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GABRG3Q99928 467 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RARRES2Q99969 163 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 OMDQ99983 421 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PRSS27Q9BQR3 290 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LIMD2Q9BT23 127 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANKRD60Q9BZ19 345 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SMDT1Q9H4I9 107 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ACTR8Q9H981 624 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SLC39A1Q9NY26 324 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa-1.62□□□□□ -2.67
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RNU6-1238P-201ENST00000517215 FAM215AQ9Y5M1 114 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MTUS2Q5JR59 1369 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ITPR2Q14571 2701 aa-1.62□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FREM3P0C091 2139 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 WDR90Q96KV7 1748 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ELP1O95163 1332 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 MAP3K19Q56UN5 1328 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 CEP192Q8TEP8 1941 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A6NCN8 305 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 LRRC30A6NM36 301 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 ANXA2P2A6NMY6 339 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 HMSDA8MTL9 139 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 A8MWP6 167 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 E9PMD0 336 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 K7EQZ3 153 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 SGK494L7N484 410 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 GPR31O00270 319 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 STX7O15400 261 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 PSTPIP1O43586 416 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 FMO6PO60774 539 aa-1.63□□□□□ -2.67
RNU6-1238P-201ENST00000517215 RDH16O75452 317 aa-1.63□□□□□ -2.67
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