RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512014.5

SH3BP2-222, Transcript of SH3 domain binding protein 2, human

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 688 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SH3BP2-222	ENST00000512014	HOXA3	O43365	443 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHV1-69	P01742	117 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAAO	P46952	286 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	CAV3	P56539	151 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR12D2	P58182	307 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	NANOS3	P60323	173 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERVK11-1	P61568	191 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL13RA1	P78552	427 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDCD1	Q15116	288 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZSCAN26	Q16670	478 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014		Q6YL49	198 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ENTHD1	Q8IYW4	607 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RDH10	Q8IZV5	341 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	KIR3DL3	Q8N743	410 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	TMIGD2	Q96BF3	282 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	LGALS12	Q96DT0	336 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZMAT3	Q9HA38	289 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	HES4	Q9HCC6	221 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	10.44	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANKRD61	A6NGH8	418 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8VVB4	439 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014		F8VWA3	439 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNASEK-C17orf49	H0YIS7	233 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SYT7	O43581	403 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	MELTF	P08582	738 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	GABRA2	P47869	451 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	MEDAG	Q5VYS4	303 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	FDX2	Q6P4F2	183 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	METAP1D	Q6UB28	335 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF573	Q86YE8	665 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PDZD9	Q8IXQ8	264 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	BATF2	Q8N1L9	274 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR2G2	Q8NGZ5	317 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RHOXF1	Q8NHV9	184 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	APH1B	Q8WW43	257 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	MED30	Q96HR3	178 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	C9orf16	Q9BUW7	83 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	CHST5	Q9GZS9	411 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RASL12	Q9NYN1	266 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	FRRS1L	Q9P0K9	344 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ONECUT1	Q9UBC0	465 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	GNG8	Q9UK08	70 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ORC6	Q9Y5N6	252 aa		10.43	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A0U1RQK1	487 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014		A0A1B0GVI7	797 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	HAX1	O00165	279 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC16A6	O15403	523 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ATP6V1E1	P36543	226 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZNF91	Q05481	1191 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	KLRD1	Q13241	179 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	HCP5	Q6MZN7	132 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	C16orf87	Q6PH81	154 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR10AC1	Q8NH08	325 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	GATAD2B	Q8WXI9	593 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SLC25A28	Q96A46	364 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PELI1	Q96FA3	418 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PKIB	Q9C010	78 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	UNKL	Q9H9P5	680 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	NOX4	Q9NPH5	578 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	FAM118A	Q9NWS6	357 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	MYRF	Q9Y2G1	1151 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	GMPPB	Q9Y5P6	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	LOC100130705	A0A1B0GUX0	176 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ERICH4	A6NGS2	130 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	OR4C45	A6NMZ5	311 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	IGHA1	P01876	353 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ISG15	P05161	165 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	UBC	P0CG48	685 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	DBT	P11182	482 aa	Known RBP	10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	NDUFB7	P17568	137 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PRDX2	P32119	198 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTC1	P68032	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ACTA1	P68133	377 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RELB	Q01201	579 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	IL24	Q13007	206 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	ZBTB49	Q6ZSB9	765 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	RNF144B	Q7Z419	303 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	LDLRAD3	Q86YD5	345 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SH3BP2-222	ENST00000512014	PNKD	Q8N490	385 aa		10.41	□□□□□ -0.74

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