RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511747.5

SH3BP2-221, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,351 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-221ENST00000511747 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-221ENST00000511747 PADI1Q9ULC6 663 aa23.64■■□□□ 1.38
SH3BP2-221ENST00000511747 SDK2Q58EX2 2172 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CD5P06127 495 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PNLIPP16233 465 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TMEM33P57088 247 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF528Q3MIS6 628 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GGNBP1Q5YKI7 109 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FAAP24Q9BTP7 215 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 EIF1BO60739 113 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 JTBO76095 146 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FCGR2CP31995 323 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 AKR1D1P51857 326 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 RRADP55042 308 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PDZK1IP1Q13113 114 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 BTNL8Q6UX41 500 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXO17Q96EF6 278 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC74BQ96LY2 380 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PRRX2Q99811 253 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 LIME1Q9H400 295 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GPR173Q9NS66 373 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FBXL17Q9UF56 701 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 A0A087WZY1 265 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MSTNO14793 375 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 VAMP5O95183 116 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 IFNA21P01568 189 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 APOC1P02654 83 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 HEXAP06865 529 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 OR5H8P0DN80 308 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CHAF1BQ13112 559 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SMCO1Q147U7 214 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 RAET1LQ5VY80 246 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 OR9K2Q8NGE7 335 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SPTSSAQ969W0 71 aa23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ANGPTL7O43827 346 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CD80P33681 288 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 RPL35P42766 123 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TAF9Q16594 264 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PARP11Q9NR21 331 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ACKR3P25106 362 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ID4P47928 161 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SHEQ5VZ18 495 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SPEM1Q8N4L4 309 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SMIM3Q9BZL3 60 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 EDARQ9UNE0 448 aa23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 LSM5Q9Y4Y9 91 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 C9JQL5 133 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CRYBA1P05813 215 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PCOLCEQ15113 449 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 OR2AE1Q8NHA4 323 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GLYATL2Q8WU03 294 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 AMDHD2Q9Y303 409 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 GDF9O60383 454 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZIC3O60481 467 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 F2RL1P55085 397 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PIGPP57054 158 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM76BQ5HYJ3 339 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SULT4A1Q9BR01 284 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ULBP2Q9BZM5 246 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 OCIAD1Q9NX40 245 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF581Q9P0T4 197 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 U3KQA8 63 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SPRY1O43609 319 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 OPRM1P35372 400 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 RSU1Q15404 277 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PLXDC2Q6UX71 529 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZIC4Q8N9L1 334 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 RXFP4Q8TDU9 374 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 METTL9Q9H1A3 318 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 AK3Q9UIJ7 227 aa23.6■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF205O95201 554 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CCL3P10147 92 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM27BQ5VT28 67 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 Q6ZRG5 221 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 CCDC54Q8NEL0 328 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 DUSP23Q9BVJ7 150 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF850A8MQ14 1090 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 G3V3Y1 287 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SCGB1D2O95969 90 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SPP1P10451 314 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 SP6Q3SY56 376 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 DHRS11Q6UWP2 260 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 MAML2Q8IZL2 1156 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 NAA11Q9BSU3 229 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa23.59■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 ZNF98A6NK75 572 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 PEA15Q15121 130 aa23.58■■□□□ 1.37
SH3BP2-221ENST00000511747 TOMM40LQ969M1 308 aa23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.9 ms