RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497037.5

ANKRD28-212, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD28, Length 3,509 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-212ENST00000497037 OR10AD1Q8NGE0 317 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR51T1Q8NGJ9 327 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BOD1Q96IK1 185 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GINS4Q9BRT9 223 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FAAP24Q9BTP7 215 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR2J1Q9GZK6 312 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PRR13Q9NZ81 148 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AK3Q9UIJ7 227 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TINAGQ9UJW2 476 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ACACAQ13085 2346 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DSCAML1Q8TD84 2053 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0A6YYH2 397 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 A6NJ64 397 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR6C65A6NJZ3 312 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SULT1C2O00338 296 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MLNRO43193 412 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PEX14O75381 377 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SIX6O95475 246 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CSF1P09603 554 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CECR9P0C854 216 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GLI4P10075 376 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IL32P24001 234 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CHATP28329 748 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ARR3P36575 388 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SNU13P55769 128 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 H2BFSP57053 126 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZBTB37Q5TC79 503 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AADACL3Q5VUY0 350 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF626Q68DY1 528 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RPUSD3Q6P087 351 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NLRC3Q7RTR2 1065 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C17orf78Q8N4C9 275 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF611Q8N823 705 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR6K3Q8NGY3 331 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR13G1Q8NGZ3 307 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 GRPEL2Q8TAA5 225 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 KCNG3Q8TAE7 436 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM230Q96A57 120 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SARAFQ96BY9 339 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RAB3CQ96E17 227 aa4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF486Q96H40 463 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PAPOLGQ9BWT3 736 aaKnown RBP4.13□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP4.13□□□□□ -1.755e-7■■■■■ 34.1
ANKRD28-212ENST00000497037 CHD8Q9HCK8 2581 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A0G2JNJ9 132 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CD300LBA8K4G0 201 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SDCBPO00560 298 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 HTR3BO95264 441 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RAB3DO95716 219 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CST4P01036 141 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IGLV1-44P01699 117 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 APOC1P02654 83 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AMY2AP04746 511 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C1QTNF9P0C862 333 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM225BP0DP42 221 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CA6P23280 308 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 PSG7Q13046 419 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LY6G6FQ5SQ64 297 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC25A26Q70HW3 274 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LRP11Q86VZ4 500 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 LDLRAD3Q86YD5 345 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DOLPP1Q86YN1 238 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FBXL14Q8N1E6 418 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SLC25A40Q8TBP6 338 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 EMG1Q92979 244 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SPSB1Q96BD6 273 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SNRNP40Q96DI7 357 aaKnown RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SCPEP1Q9HB40 452 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 Q9UFV3 132 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RABL2BQ9UNT1 228 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NPTNQ9Y639 398 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 A0A1B0GUH1 482 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 NAP1L6A6NFF2 107 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 AHRRA9YTQ3 701 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 FABP7O15540 132 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DSCAMO60469 2012 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 WDR1O75083 606 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 DUSP1P28562 367 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 RBP2P50120 134 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TAS2R19P59542 299 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CDSNQ15517 529 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 CEACAM21Q3KPI0 293 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C1orf185Q5T7R7 199 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 TMEM53Q6P2H8 277 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 C20orf204Q6ZNR8 217 aa4.12□□□□□ -1.75
ANKRD28-212ENST00000497037 IDO2Q6ZQW0 420 aa4.12□□□□□ -1.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.3 ms