RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495350.5

CBX1-205, Transcript of chromobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CBX1, Length 550 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX1-205ENST00000495350 COMMD1Q8N668 190 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM86B1Q8N7N1 296 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR8J3Q8NGG0 315 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR4Q3Q8NH05 313 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR8U1Q8NH10 309 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM81AQ8TBF8 368 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CHPT1Q8WUD6 406 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PIGCQ92535 297 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DUX3Q96PT4 197 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RGCCQ9H4X1 137 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 BRD7Q9NPI1 651 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ARL8BQ9NVJ2 186 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 VNN3Q9NY84 501 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RASL12Q9NYN1 266 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TAGLN3Q9UI15 199 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF222Q9UK12 451 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SNX13Q9Y5W8 968 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SORL1Q92673 2214 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.89□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TVP23AA6NH52 213 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SH2D7A6NKC9 451 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM220BPB1ANY3 271 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FXYD1O00168 92 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FFAR1O14842 300 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ARPC3O15145 178 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MTRF1O75570 445 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 H1F0P07305 194 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PRDX2P32119 198 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PYCR1P32322 319 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NUDT2P50583 147 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 GNG3P63215 75 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF260Q3ZCT1 412 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HACD2Q6Y1H2 254 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 C18orf65Q6ZTR6 163 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 GDPD3Q7L5L3 318 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OVCH2Q7RTZ1 564 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ARPINQ7Z6K5 226 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 VTCN1Q7Z7D3 282 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF676Q8N7Q3 588 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ASCC1Q8N9N2 400 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR2T12Q8NG77 320 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR2T4Q8NH00 348 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR5P3Q8WZ94 311 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SGK3Q96BR1 496 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PGAM5Q96HS1 289 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NSL1Q96IY1 281 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF714Q96N38 554 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 RBM14Q96PK6 669 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 HOPXQ9BPY8 73 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CLEC7AQ9BXN2 247 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR52D1Q9H346 318 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TBC1D23Q9NUY8 699 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR14J1Q9UGF5 321 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa4.88□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 A0A1W2PRQ8 180 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR6C68A6NDL8 312 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OR5B21A6NL26 309 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SERPINE3A8MV23 424 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF732B4DXR9 585 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 GSTA4O15217 222 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 IDH3BO43837 385 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 NXPH2O95156 264 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SERPINA1P01009 418 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CST4P01036 141 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 TK1P04183 234 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CALB2P22676 271 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CD24P25063 80 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FMO3P31513 532 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DCTDP32321 178 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CEACAM3P40198 252 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MNDAP41218 407 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 OMPP47874 163 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 INSL3P51460 131 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 MNAT1P51948 309 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ZNF121P58317 390 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FXYD6P3P58550 94 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 PSME3P61289 254 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 DGCR6Q14129 220 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 FAM76BQ5HYJ3 339 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CEP78Q5JTW2 689 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 ACP7Q6ZNF0 438 aa4.87□□□□□ -1.63
CBX1-205ENST00000495350 LCNL1Q6ZST4 164 aa4.87□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 62.8 ms