RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494395.1

ITGB1-217, Transcript of integrin subunit beta 1, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB1, Length 562 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB1-217ENST00000494395 PIPP12273 146 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 PCMT1P22061 227 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 GATA3P23771 443 aa7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 MPZP25189 248 aa7.29□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 UBE2V2Q15819 145 aa7.29□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 XAF1Q6GPH4 301 aa7.29□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 C10orf35Q96D05 121 aa7.29□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa7.28□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 OR8B3Q8NGG8 313 aa7.28□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 WDR13Q9H1Z4 485 aa7.28□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 DUX4Q9UBX2 424 aa7.28□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 CAB39Q9Y376 341 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 INSIG2Q9Y5U4 225 aa7.28□□□□□ -1.24
ITGB1-217ENST00000494395 JMJD1CQ15652 2540 aa7.28□□□□□ -1.24
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ITGB1-217ENST00000494395 IRGMA1A4Y4 181 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 ANKRD61A6NGH8 418 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 TMEM212A6NML5 194 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 J3QT63 122 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 AKR7A2O43488 359 aa7.27□□□□□ -1.25
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ITGB1-217ENST00000494395 NDUFA2O43678 99 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 SYNGR1O43759 233 aa7.27□□□□□ -1.25
ITGB1-217ENST00000494395 LALBAP00709 142 aa7.27□□□□□ -1.25
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