RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493601.5

PTPRU-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, human

TSL 5

Gene PTPRU, Length 695 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PPE2	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PR64	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A1W2PRV1	198 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TCRBV3S1	A0A5B6	114 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PRR32	B1ATL7	298 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	LOC110117498-PIK3R3	F6TDL0	507 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		J3QT63	122 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	GYG2	O15488	501 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MFGE8	Q08431	387 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	AANAT	Q16613	207 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	HCP5	Q6MZN7	132 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FAHD1	Q6P587	224 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	OR4C13	Q8NGP0	309 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	OR5K1	Q8NHB7	308 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SSX3	Q99909	188 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RAB18	Q9NP72	206 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	COPS3	Q9UNS2	423 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NXPH2	O95156	264 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TTR	P02766	147 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CSF1	P09603	554 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PGA5	P0DJD9	388 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	HAAO	P46952	286 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ACTR3	P61158	418 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ESRRG	P62508	458 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC35E4	Q6ICL7	350 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	C11orf88	Q6PI97	169 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CD177	Q8N6Q3	437 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	C17orf50	Q8WW18	174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MNT	Q99583	582 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	HEXA-AS1	Q9H8Q6	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	USE1	Q9NZ43	259 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	AKAP8L	Q9ULX6	646 aa	Known RBP eCLIP	13.54	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		A0A0G2JK05	382 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	DLGAP1	O14490	977 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SYNGR1	O43759	233 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PRKY	O43930	277 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SRSF10	O75494	262 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PRDX2	P32119	198 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	CXCR4	P61073	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM42	Q69YG0	159 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF322	Q6U7Q0	402 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		Q6ZTK2	550 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	SLC35F2	Q8IXU6	374 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MKX	Q8IYA7	352 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF488	Q96MN9	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	RANBP3	Q9H6Z4	567 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601		R4GMQ9	66 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PTPRU-208	ENST00000493601	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	DAP	P51397	102 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	HERPUD1	Q15011	391 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	LY6E	Q16553	131 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	NXNL2	Q5VZ03	156 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	ELMOD2	Q8IZ81	293 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2T6	Q8NHC8	308 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	RORB	Q92753	470 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	PPP1R14A	Q96A00	147 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	APOL4	Q9BPW4	351 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	GPR173	Q9NS66	373 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	POMP	Q9Y244	141 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601		V9GYS6	101 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	ZNF670-ZNF695	F2Z2N8	137 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	MPZ	P25189	248 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	KIR2DS4	P43632	304 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	EFNB2	P52799	333 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	LGALS4	P56470	323 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	ERVFRD-1	P60508	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	ASRGL1	Q7L266	308 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	GID4	Q8IVV7	300 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	DTX3	Q8N9I9	347 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	OR2T27	Q8NH04	317 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	TMEM163	Q8TC26	289 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	HES4	Q9HCC6	221 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	KRT84	Q9NSB2	600 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	OR52A1	Q9UKL2	312 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601		M0R129	80 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PTPRU-208	ENST00000493601	DNAJC8	O75937	253 aa	Predicted RBP	13.5	□□□□□ -0.25

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