RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485459.5

RABGGTB-210, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 788 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-210ENST00000485459 CEACAM4O75871 244 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NDUFB6O95139 128 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SERPIND1P05546 499 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 BCHEP06276 602 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SOD3P08294 240 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 LAMP1P11279 417 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A4P12235 298 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GP1BBP13224 206 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CD27P26842 260 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TEAD1P28347 426 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 APLNRP35414 380 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR3A1P47881 315 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CAV2P51636 162 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CCR8P51685 355 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GEMP55040 296 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 H2BFSP57053 126 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ERVPABLB-1P60509 514 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 PRPS1P60891 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SELENOTP62341 195 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SRSF5Q13243 272 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF345Q14585 488 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HAGHQ16775 308 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 LINC00303Q3SY05 128 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CRY2Q49AN0 593 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 PDZD11Q5EBL8 140 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ARMC12Q5T9G4 340 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8G2PQ6IF36 304 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2A2Q6IF42 318 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ADNP2Q6IQ32 1131 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SFXN4Q6P4A7 337 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CD300LGQ6UXG3 332 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF620Q6ZNG0 422 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ACOT7LQ6ZUV0 252 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HIST2H3AQ71DI3 136 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SSX7Q7RTT5 188 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 C5orf24Q7Z6I8 188 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SCD5Q86SK9 330 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF573Q86YE8 665 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TRAPPC5Q8IUR0 188 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC30A8Q8IWU4 369 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GCNT2Q8N0V5 402 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ABHD12Q8N2K0 398 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 KDM8Q8N371 416 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 FAM89BQ8N5H3 189 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 JAGN1Q8N5M9 183 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 BHLHE23Q8NDY6 225 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 BBS1Q8NFJ9 593 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4F15Q8NGB8 312 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR52E1Q8NGJ3 308 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR8J1Q8NGP2 316 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR2A12Q8NGT7 310 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 OR4C6Q8NH72 309 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 RHEBL1Q8TAI7 183 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NUBPLQ8TB37 319 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 PIGXQ8TBF5 258 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 STAG3L4Q8TBR4 150 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR148Q8TDV2 347 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SMIM4Q8WVI0 70 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 MRPS31Q92665 395 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 THRSPQ92748 146 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TOMM40LQ969M1 308 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NTNG2Q96CW9 530 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SMARCD1Q96GM5 515 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC41A3Q96GZ6 507 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 PACRGQ96M98 296 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF2Q9BSG1 426 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 DOHHQ9BU89 302 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ZNF350Q9GZX5 532 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC25A31Q9H0C2 315 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 RGCCQ9H4X1 137 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 AUNIPQ9H7T9 357 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 NMNAT1Q9HAN9 279 aaPredicted RBP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 LRTM1Q9HBL6 345 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 LPAR2Q9HBW0 351 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 DNAJC4Q9NNZ3 241 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 MYOZ2Q9NPC6 264 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 APOBEC3CQ9NRW3 190 aaKnown RBP eCLIP3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GPR173Q9NS66 373 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TREX1Q9NSU2 369 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 CBLN4Q9NTU7 201 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM100Q9NV29 134 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TVP23BQ9NYZ1 205 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GALPQ9UBC7 116 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TNFSF18Q9UNG2 199 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 HDGFL3Q9Y3E1 203 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 V9GYS6 101 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 GBF1Q92538 1859 aa3.39□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 ABCA7Q8IZY2 2146 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 BTAF1O14981 1849 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa3.38□□□□□ -1.87
RABGGTB-210ENST00000485459 SLC5A10A0PJK1 596 aa3.38□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60.6 ms