RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP16.49■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 COPS3Q9UNS2 423 aa16.49■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 RFPL4AA6NLU0 287 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 PRKYO43930 277 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 TTRP02766 147 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 DAPP51397 102 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 LGALS4P56470 323 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ASPHD2Q6ICH7 369 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 FAHD1Q6P587 224 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 TCEANCQ8N8B7 351 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 POC1AQ8NBT0 407 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 BEND2Q8NDZ0 799 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 SSX3Q99909 188 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ENOPH1Q9UHY7 261 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 SNX5Q9Y5X3 404 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 R4GMQ9 66 aa16.48■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 G3V2T6 193 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 H3BUX3 64 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 J3QT63 122 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 DLGAP1O14490 977 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 TSPAN9O75954 239 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 NXPH2O95156 264 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 IGLV3-1P01715 115 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 PRDX2P32119 198 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 KRTAP10-3P60369 221 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 RPL31P62899 125 aaKnown RBP16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 NXNL2Q5VZ03 156 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ASRGL1Q7L266 308 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 GID4Q8IVV7 300 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R14AQ96A00 147 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 APOL4Q9BPW4 351 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 GPR173Q9NS66 373 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ZNF222Q9UK12 451 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 OR52A1Q9UKL2 312 aa16.47■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 SYNGR1O43759 233 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 EGR3Q06889 387 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ELMOD2Q8IZ81 293 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 DTX3Q8N9I9 347 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 OR2T27Q8NH04 317 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ZNF488Q96MN9 340 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 ADI1Q9BV57 179 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHA1Q9HB21 404 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 RAB18Q9NP72 206 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 C19orf12Q9NSK7 152 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 USE1Q9NZ43 259 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.46■□□□□ 0.23
ACTB-212ENST00000484841 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 KRT8P05787 483 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PGA5P0DJD9 388 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 GABRA5P31644 462 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 C2orf68Q2NKX9 166 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SLC35E4Q6ICL7 350 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 YIPF7Q8N8F6 280 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR4C13Q8NGP0 309 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TMEM163Q8TC26 289 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ADGRL4Q9HBW9 690 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CLN6Q9NWW5 311 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A11Q9UPY5 501 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 V9GYS6 101 aa16.45■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PRR32B1ATL7 298 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 RPP14O95059 124 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ATP6V1E1P36543 226 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ERVFRD-1P60508 538 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 LY6EQ16553 131 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SLX4IPQ5VYV7 408 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 Q6ZTK2 550 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 MKXQ8IYA7 352 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CD177Q8N6Q3 437 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR4M1Q8NGD0 313 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 IL4I1Q96RQ9 567 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 FBLN5Q9UBX5 448 aa16.44■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TET2Q6N021 2002 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 A6NIN4 97 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 DHRS7CA6NNS2 312 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CSF1P09603 554 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 FASP25445 335 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 RASSF2P50749 326 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 AADACL4Q5VUY2 407 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TMEM200BQ69YZ2 307 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 C11orf88Q6PI97 169 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 BATF2Q8N1L9 274 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 OR14K1Q8NGZ2 314 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 TBX5Q99593 518 aa16.43■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 PQLC2LA1A4F0 135 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 ZAR1LA6NP61 321 aa16.42■□□□□ 0.22
ACTB-212ENST00000484841 M0R129 80 aa16.42■□□□□ 0.22
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