RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482936.5

RTEL1-TNFRSF6B-202, Transcript of RTEL1-TNFRSF6B readthrough (NMD candidate), humanhuman

APPRIS P5 TSL 2 BASIC

Gene RTEL1-TNFRSF6B, Length 4,931 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 OGG1O15527 345 aa14.74□□□□□ -0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 BAGE2Q86Y30 109 aa14.73□□□□□ -0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 PSENENQ9NZ42 101 aa14.72□□□□□ -0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 IGHV3-7P01780 117 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CLLU1Q5K131 121 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RHOFQ9HBH0 211 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 SLC17A5Q9NRA2 495 aa14.71□□□□□ -0.05
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ANK1P16157 1881 aa14.71□□□□□ -0.05
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RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 RAG2P55895 527 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 TSPO2Q5TGU0 170 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CDC20BQ86Y33 519 aa14.71□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CSRP3P50461 194 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 MGAT2Q10469 447 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ERGIC1Q969X5 290 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ICAM5Q9UMF0 924 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf170A2RU37 121 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 CHRNB4P30926 498 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 ZNF787Q6DD87 383 aa14.7□□□□□ -0.06
RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 C9orf40Q8IXQ3 194 aa14.7□□□□□ -0.06
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