RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000469757.1

TRAPPC3-206, Transcript of trafficking protein particle complex 3, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC3, Length 221 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3-206ENST00000469757 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13C3Q8NGS6 347 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ANGPTL6Q8NI99 470 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PDCD1LG2Q9BQ51 273 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR173Q9NS66 373 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RASL12Q9NYN1 266 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PCDHGB5Q9Y5G0 923 aa6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 IGHV2-70DA0A0C4DH43 119 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SULT1B1O43704 296 aa6.9□□□□□ -1.3
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF205O95201 554 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPINA3P01011 423 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM157CP0CG43 387 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PPIAL4GP0DN37 164 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF20P17024 532 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 ATF1P18846 271 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 AMY2BP19961 511 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 PRKACBP22694 351 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 AZGP1P25311 298 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 HAAOP46952 286 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 FUT6P51993 359 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GABARAPL2P60520 117 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TBCEQ15813 527 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 TUSC1Q2TAM9 212 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR25Q64LD2 544 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 HAGHLQ6PII5 290 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 LYPD2Q6UXB3 125 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 KCTD8Q6ZWB6 473 aa6.9□□□□□ -1.3
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TRAPPC3-206ENST00000469757 TEX29Q8N6K0 151 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 GPR148Q8TDV2 347 aa6.9□□□□□ -1.3
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MND1Q9BWT6 205 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 SMURF1Q9HCE7 757 aa6.9□□□□□ -1.3
TRAPPC3-206ENST00000469757 CHCHD3Q9NX63 227 aaKnown RBP6.9□□□□□ -1.3
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TRAPPC3-206ENST00000469757 C22orf46C9J442 243 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 TRAPPC2LH3BP13 241 aa6.89□□□□□ -1.31
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TRAPPC3-206ENST00000469757 SIGLEC5O15389 551 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
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TRAPPC3-206ENST00000469757 MRPS14O60783 128 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
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TRAPPC3-206ENST00000469757 GYPAP02724 150 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 CD2P06729 351 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 RBP2P50120 134 aa6.89□□□□□ -1.31
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TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF788Q6ZQV5 615 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 C1QL2Q7Z5L3 287 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 SERPINA12Q8IW75 414 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 Q8IYB0 196 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 SAXO1Q8IYX7 474 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 FAM216BQ8N7L0 139 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR5D14Q8NGL3 314 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 OR13C9Q8NGT0 318 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 C8orf46Q8TAG6 207 aa6.89□□□□□ -1.31
TRAPPC3-206ENST00000469757 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.89□□□□□ -1.31
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