RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465425.1

SYNE4-204, Transcript of spectrin repeat containing nuclear envelope family member 4, humanhuman

TSL 2

Gene SYNE4, Length 2,339 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE4-204ENST00000465425 SYNGR3O43761 229 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 HOXA6P31267 233 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZFP36L1Q07352 338 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 TAF9Q16594 264 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FAM122CQ6P4D5 195 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 OR1F12Q8NHA8 337 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ALKBH3Q96Q83 286 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ANXA10Q9UJ72 324 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 MYO7BQ6PIF6 2116 aa15.98■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CCDC187A0A096LP49 1063 aa15.97■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 B4GALT1P15291 398 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CTRB1P17538 263 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SRD5A2P31213 254 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PTGER4P35408 488 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CTRB2Q6GPI1 263 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 KCNE4Q8WWG9 221 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 NTNG2Q96CW9 530 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 BORCS8Q96FH0 119 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PATE3B3GLJ2 98 aa15.97■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa15.97■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 RBP2P50120 134 aa15.97■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 IAH1Q2TAA2 248 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 FAAP24Q9BTP7 215 aa15.97■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 NUDT19A8MXV4 375 aa15.96■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 STK11Q15831 433 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 AAED1Q7RTV5 226 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 WDR5BQ86VZ2 330 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 FNDC9Q8TBE3 224 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 CMSS1Q9BQ75 279 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PADI1Q9ULC6 663 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF850A8MQ14 1090 aa15.96■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 ZNF32P17041 273 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 PRSS12P56730 875 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 SMCO1Q147U7 214 aa15.96■□□□□ 0.15
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SYNE4-204ENST00000465425 SLC5A7Q9GZV3 580 aa15.96■□□□□ 0.15
SYNE4-204ENST00000465425 A0A0G2JMM0 328 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PPB8 328 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 A0A1W2PRS3 328 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 FAM74A7A6NL05 159 aa15.95■□□□□ 0.14
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SYNE4-204ENST00000465425 TAAR5O14804 337 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 TSPAN9O75954 239 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 CER1O95813 267 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ACTL6AO96019 429 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 B3GALT5-AS1P59052 145 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 IL15RAQ13261 267 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 RBM39Q14498 530 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 FAM74A3Q4VXF1 159 aa15.95■□□□□ 0.14
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SYNE4-204ENST00000465425 CLRN3Q8NCR9 226 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 AKR7LQ8NHP1 331 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 MMP26Q9NRE1 261 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 NECAP2Q9NVZ3 263 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 AK3Q9UIJ7 227 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 HSF4Q9ULV5 492 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 PMS2P1A4D2B8 440 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 CXCL13O43927 109 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 TRAPPC6AO75865 159 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 NRASP01111 189 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 PATE4P0C8F1 98 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 OTX2P32243 289 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 HGFACQ04756 655 aa15.95■□□□□ 0.14
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SYNE4-204ENST00000465425 LPAR3Q9UBY5 353 aa15.95■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 IGHEP01854 428 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ICAM2P13598 275 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 NTF4P34130 210 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 RRADP55042 308 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 GGNQ86UU5 652 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 TOMM40LQ969M1 308 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 FOXB1Q99853 325 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF629Q9UEG4 869 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF391Q9UJN7 358 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 DMDP11532 3685 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 ZNF716A6NP11 495 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 F8W036 122 aa15.94■□□□□ 0.14
SYNE4-204ENST00000465425 GPR31O00270 319 aa15.94■□□□□ 0.14
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