RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000452979.5

HERC3-207, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 3

Gene HERC3, Length 887 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-207ENST00000452979 A0A1W2PRM7 423 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 H3BUX3 64 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CDIPTO14735 213 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 XPNPEP2O43895 674 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PRB2P02812 416 aaPredicted RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SLC2A1P11166 492 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 DBTP11182 482 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PRKXP51817 358 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CSNK2BP67870 215 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 KLRD1Q13241 179 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 IKZF1Q13422 519 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 AANATQ16613 207 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 LCN1P1Q5VSP4 162 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PRSS45Q7RTY3 260 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 DTX3Q8N9I9 347 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SLAMF6Q96DU3 332 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SSX3Q99909 188 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 COPS4Q9BT78 406 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CLN6Q9NWW5 311 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 DNAJB11Q9UBS4 358 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 FOXJ3Q9UPW0 622 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa9.51□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 MEGF11A6BM72 1044 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PRR32B1ATL7 298 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SLC1A7O00341 560 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SPARCP09486 303 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SLC15A1P46059 708 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ENTPD1P49961 510 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CAV3P56539 151 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 LOXL3P58215 753 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 TAF13Q15543 124 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 DGUOKQ16854 277 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 HCP5Q6MZN7 132 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ERI1Q8IV48 349 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR5T2Q8NGG2 359 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR51G2Q8NGK0 314 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR4C13Q8NGP0 309 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR6N2Q8NGY6 317 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR2T6Q8NHC8 308 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ANGPTL6Q8NI99 470 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SGCDQ92629 289 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 RFKQ969G6 155 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 LGALS12Q96DT0 336 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ITPKCQ96DU7 683 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 RNFT2Q96EX2 444 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 MED30Q96HR3 178 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 REEP6Q96HR9 211 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 INTS14Q96SY0 518 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 AMELYQ99218 206 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 Q9H521 79 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PPP1R3EQ9H7J1 279 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SP140LQ9H930 580 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CENPMQ9NSP4 180 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 WARS2Q9UGM6 360 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 COPS3Q9UNS2 423 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 LRRC42Q9Y546 428 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 N6AMT1Q9Y5N5 214 aa9.5□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 hCG_38984A0A1B0GV85 526 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ZNF878C9JN71 531 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 J3QRE1 110 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SELLP14151 372 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CFL1P23528 166 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 GSK3AP49840 483 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 BLVRAP53004 296 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 HCCSP53701 268 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 GRB2P62993 217 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 TMED1Q13445 227 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 TIGD6Q17RP2 521 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 C6orf141Q5SZD1 244 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 KLHDC1Q8N7A1 406 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 C11orf44Q8N8P7 122 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 BPIFB6Q8NFQ5 453 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 OR52H1Q8NGJ2 320 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 C17orf50Q8WW18 174 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 Q96MT0 163 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 GAFA1Q96PS6 74 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 MICU1Q9BPX6 476 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 WDR13Q9H1Z4 485 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 RAB18Q9NP72 206 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 NECAP2Q9NVZ3 263 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 FKBP14Q9NWM8 211 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 H2AFY2Q9P0M6 372 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SLC25A10Q9UBX3 287 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 RHBDD3Q9Y3P4 386 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 MPC1Q9Y5U8 109 aa9.49□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 NKX6-3A6NJ46 265 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 TMEM210A6NLX4 147 aa9.48□□□□□ -0.89
HERC3-207ENST00000452979 SIGLEC5O15389 551 aa9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.5 ms