RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439057.5

KDM4A-AS1-204, KDM4A antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene KDM4A-AS1, Length 686 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SYT7O43581 403 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ATP6V1E1P36543 226 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CAV3P56539 151 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 BPIFB3P59826 476 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ACTC1P68032 377 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ACTA1P68133 377 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZNF91Q05481 1191 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PDCD1Q15116 288 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FAM220AQ7Z4H9 259 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 BATF2Q8N1L9 274 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CD177Q8N6Q3 437 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZNF671Q8TAW3 534 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GATAD2BQ8WXI9 593 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SDSLQ96GA7 329 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 DMRTB1Q96MA1 342 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NRIP2Q9BQI9 281 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CHST5Q9GZS9 411 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 HES4Q9HCC6 221 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SIRT7Q9NRC8 400 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.66□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MELTFP08582 738 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GABRA2P47869 451 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 KLRD1Q13241 179 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 UBE2V2Q15819 145 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SMIM21Q3B7S5 101 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MEDAGQ5VYS4 303 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZNF573Q86YE8 665 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PDZD9Q8IXQ8 264 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PIP4P2Q8N4L2 257 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZNRF1Q8ND25 227 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 OR2G2Q8NGZ5 317 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NPRL2Q8WTW4 380 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 TNFRSF14Q92956 283 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 LGALS12Q96DT0 336 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PLEKHA1Q9HB21 404 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GMPPBQ9Y5P6 360 aa12.65□□□□□ -0.38
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 A0A0U1RQK1 487 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SLC16A6O15403 523 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 UBCP0CG48 685 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 DBTP11182 482 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NDUFB7P17568 137 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 OR12D2P58182 307 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ERVK11-1P61568 191 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FDX2Q6P4F2 183 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 Q6YL49 198 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ANGPTL5Q86XS5 388 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RDH10Q8IZV5 341 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 TMEM185AQ8NFB2 350 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 APH1BQ8WW43 257 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 SLC25A28Q96A46 364 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MED30Q96HR3 178 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZNF649Q9BS31 505 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PKIBQ9C010 78 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RASL12Q9NYN1 266 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa12.64□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RFPL4AA6NLU0 287 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZBTB49Q6ZSB9 765 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 OR10AC1Q8NH08 325 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 PELI1Q96FA3 418 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 C4orf36Q96KX1 117 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 NOX4Q9NPH5 578 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 C19orf12Q9NSK7 152 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FRRS1LQ9P0K9 344 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 MYRFQ9Y2G1 1151 aa12.63□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FAM230AA0A1W2PPH8 454 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 DAPL1A0PJW8 107 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 F8VVB4 439 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 F8VWA3 439 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 GATBO75879 557 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 IGHA1P01876 353 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 IL24Q13007 206 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 HCP5Q6MZN7 132 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 LDLRAD3Q86YD5 345 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 C10orf67Q8IYJ2 551 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 ACBD7Q8N6N7 88 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 RHOXF1Q8NHV9 184 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 C10orf35Q96D05 121 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 CHIAQ9BZP6 476 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 UNKLQ9H9P5 680 aaKnown RBP12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 FAM118AQ9NWS6 357 aa12.62□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa12.61□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa12.61□□□□□ -0.39
KDM4A-AS1-204ENST00000439057 OR4C45A6NMZ5 311 aa12.61□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.3 ms