RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429738.1

MRPL28-203, Transcript of mitochondrial ribosomal protein L28, human

TSL 2 BASIC

Gene MRPL28, Length 310 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MRPL28-203	ENST00000429738	RASL12	Q9NYN1	266 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	WARS2	Q9UGM6	360 aa	Known RBP	14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	SNX5	Q9Y5X3	404 aa		14.53	□□□□□ -0.08
MRPL28-203	ENST00000429738	DHRS7C	A6NNS2	312 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		M0R1W7	72 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CCL1	P22362	96 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GABRA2	P47869	451 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DLX1	P56177	255 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLVS2	Q5SYC1	327 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF684	Q5T5D7	378 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BCL2L15	Q5TBC7	163 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ACP7	Q6ZNF0	438 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR51G2	Q8NGK0	314 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RBM4B	Q9BQ04	359 aa	Known RBP	14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF281	Q9Y2X9	895 aa		14.52	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SYNGR1	O43759	233 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PGA5	P0DJD9	388 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NDUFB7	P17568	137 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	MPZ	P25189	248 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HTR1F	P30939	366 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HAAO	P46952	286 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KRTAP10-3	P60369	221 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PRB3	Q04118	309 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KLRD1	Q13241	179 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF573	Q86YE8	665 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CENPN	Q96H22	339 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OSBPL10	Q9BXB5	764 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SEMA6A	Q9H2E6	1030 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ELL3	Q9HB65	397 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OAZ3	Q9UMX2	235 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GTF2A1L	Q9UNN4	478 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SLC22A13	Q9Y226	551 aa		14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CAB39	Q9Y376	341 aa	Predicted RBP	14.51	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TRBV23-1	A0A0A0MS06	115 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQL4	384 aa	Predicted RBP	14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		J3QT63	122 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NPFF	O15130	113 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR137B	O60478	399 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FBP1	P09467	338 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T7	P0C7T2	308 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2E1	P51965	193 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CD177	Q8N6Q3	437 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR2T27	Q8NH04	317 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	UBE2F	Q969M7	185 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DPAGT1	Q9H3H5	408 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HES4	Q9HCC6	221 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GPR173	Q9NS66	373 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	FAM96B	Q9Y3D0	163 aa		14.5	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		A0A1W2PQ09	198 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RFPL4A	A6NLU0	287 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RFPL4AL1	F8VTS6	287 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	KRT8	P05787	483 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	EEF1B2	P24534	225 aa	Known RBP	14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TMED1	Q13445	227 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TAF9	Q16594	264 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SMIM21	Q3B7S5	101 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	HCP5	Q6MZN7	132 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ASRGL1	Q7L266	308 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF488	Q96MN9	340 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	TBX5	Q99593	518 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	NRIP2	Q9BQI9	281 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF114	Q9Y508	228 aa		14.49	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	DSCAML1	Q8TD84	2053 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		A6NIN4	97 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SULT1C4	O75897	302 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RPP14	O95059	124 aa	Known RBP	14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	SAA4	P35542	130 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ISL1	P61371	349 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ERVK11-1	P61568	191 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ACSM1	Q08AH1	577 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CALHM1	Q8IU99	346 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PNKD	Q8N490	385 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZNF561	Q8N587	486 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	LINC01006	Q8NI28	216 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RORB	Q92753	470 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	EME1	Q96AY2	570 aa		14.48	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	METTL15	A6NJ78	407 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738		E9PQ18	207 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	CLPX	O76031	633 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	APOL3	O95236	402 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PRDX2	P32119	198 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	BLMH	Q13867	455 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	GDPGP1	Q6ZNW5	385 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	ZSCAN4	Q8NAM6	433 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RNF166	Q96A37	237 aa	Predicted RBP	14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	PKIB	Q9C010	78 aa		14.47	□□□□□ -0.09
MRPL28-203	ENST00000429738	RIBC2	Q9H4K1	309 aa		14.47	□□□□□ -0.09

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