RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000401498.6

PKDCC-202, Transcript of protein kinase domain containing, cytoplasmic, humanhuman

TSL 5

Gene PKDCC, Length 1,550 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDCC-202ENST00000401498 ATP1B3P54709 279 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MTCP1P56278 107 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 GMFBP60983 142 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 INSL4Q14641 139 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TEX36Q5VZQ5 186 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 CRIP3Q6Q6R5 217 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 BIVMQ86UB2 503 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 C1orf159Q96HA4 380 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SPACA5Q96QH8 159 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PKIBQ9C010 78 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 A0A1W2PPK0 400 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 CEACAM18A8MTB9 384 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 FAM157AC9JC47 383 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 OCMP0CE72 109 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 UBE2UQ5VVX9 321 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 LHFPL2Q6ZUX7 228 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 FAM90A1Q86YD7 464 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PHC2Q8IXK0 858 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 DERL3Q96Q80 235 aa25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 IGHV3OR15-7A0A075B7D8 119 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 LY6G6DO95868 133 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RAB3AP20336 220 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 IL24Q13007 206 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 ZNF488Q96MN9 340 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PCDHB10Q9UN67 800 aa25.17■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP25.16■■□□□ 1.622e-7■■■■□ 21.9
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PIN1P1O15428 100 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PLATP00750 562 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 HEXAP06865 529 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SMIM18P0DKX4 95 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 ACSM3Q53FZ2 586 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 ARMCX4Q5H9R4 360 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RAB39BQ96DA2 213 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa25.16■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TRIM64CA6NLI5 447 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SC5DO75845 299 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 PGA5P0DJD9 388 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 GZMKP49863 264 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 LYPD2Q6UXB3 125 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 UNQ9370/PRO34162Q6UXP9 181 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 POC1AQ8NBT0 407 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM203Q969S6 136 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RFT1Q96AA3 541 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa25.15■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 A0A087WXM4 84 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 F5H0A9 414 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 GPX5O75715 221 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 HCKP08631 526 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 GLRA1P23415 457 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 RPS25P62851 125 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SSX1Q16384 188 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MICBQ29980 383 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 CYB5R2Q6BCY4 276 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 DCDC5Q6ZRR9 648 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 SLC25A26Q70HW3 274 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 NEK6Q9HC98 313 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 NOX4Q9NPH5 578 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MTCH1Q9NZJ7 389 aa25.14■■□□□ 1.62
PKDCC-202ENST00000401498 MAGEA13PA6NCF6 341 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 GYPAP02724 150 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 WNT2P09544 360 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TGFBR2P37173 567 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 KISS1Q15726 138 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 KCNJ8Q15842 424 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CLEC9AQ6UXN8 241 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 FCGR1BQ92637 280 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 NRIP2Q9BQI9 281 aa25.14■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 FSTP19883 344 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 POU3F4P49335 361 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 SEC61A1P61619 476 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 BATF2Q8N1L9 274 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 OR52N4Q8NGI2 321 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 THRSPQ92748 146 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 SNTG1Q9NSN8 517 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 MIOXQ9UGB7 285 aa25.13■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CD5LO43866 347 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 INMTO95050 263 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 ERVK11-1P61568 191 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 PPP3R1P63098 170 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 PDZK1IP1Q13113 114 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 LINC01356Q8N9X3 169 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 OR5T2Q8NGG2 359 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 SLAMF9Q96A28 289 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 TMEM138Q9NPI0 162 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 CKLFQ9UBR5 152 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 DNAJB11Q9UBS4 358 aa25.12■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 F8VVB4 439 aa25.11■■□□□ 1.61
PKDCC-202ENST00000401498 F8VWA3 439 aa25.11■■□□□ 1.61
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