RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000393028.5

GIPC1-202, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene GIPC1, Length 1,483 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-202ENST00000393028 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP23.81■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 SLC22A1O15245 554 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 EFNA4P52798 201 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PDZK1IP1Q13113 114 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 USP43Q70EL4 1123 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 SLAMF9Q96A28 289 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PERPQ96FX8 193 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF488Q96MN9 340 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PKIBQ9C010 78 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PLGRKTQ9HBL7 147 aa23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 CSMD2Q7Z408 3487 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 IL1AP01583 271 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM225BP0DP42 221 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 DAOP14920 347 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 DNASE1P24855 282 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 COL8A2P25067 703 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 MPZP25189 248 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PTH2RP49190 550 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 GMFBP60983 142 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 C1QL2Q7Z5L3 287 aa23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PNLDC1Q8NA58 520 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 CYB5R3P00387 301 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 IGKV1D-12P01611 117 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 SLC2A2P11168 524 aaPredicted RBP23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 ATP5J2P56134 94 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 CDH26Q8IXH8 852 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 LRRC29Q8WV35 223 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 CCL17Q92583 94 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 UQCC2Q9BRT2 126 aa23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP23.78■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 A6NHS1 94 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 AKR7A2O43488 359 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 F12P00748 615 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 PTGFRP43088 359 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 CLDN12P56749 244 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 IL24Q13007 206 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 P2RY14Q15391 338 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 C1orf100Q5SVJ3 147 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 AWAT2Q6E213 333 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 SFXN4Q6P4A7 337 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 BOLLQ8N9W6 283 aaKnown RBP23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 Q8TCH9 128 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 ERGIC1Q969X5 290 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 FOXRED1Q96CU9 486 aaPredicted RBP23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 KCNK15Q9H427 330 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 NDUFA13Q9P0J0 144 aa23.77■■□□□ 1.4
GIPC1-202ENST00000393028 IFITM5A6NNB3 132 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 NOTOA8MTQ0 251 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC17A2O00624 439 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 CD37P11049 281 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 EGR1P18146 543 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 HTR2CP28335 458 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 RAB11BQ15907 218 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 OR11L1Q8NGX0 322 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 OR51F2Q8NH61 342 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 RDH5Q92781 318 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 ELL3Q9HB65 397 aaPredicted RBP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 TMEM106BQ9NUM4 274 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 MTCH1Q9NZJ7 389 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP23.76■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 A0A0B4J203 849 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 RP2O75695 350 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 PSMD7P51665 324 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 CARTPTQ16568 116 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 FAM201AQ5SY85 155 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 FAM166AQ6J272 317 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 OR6M1Q8NGM8 313 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 OR10K1Q8NGX5 313 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 SMURF1Q9HCE7 757 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 RNF7Q9UBF6 113 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 DAPK2Q9UIK4 370 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 EDARQ9UNE0 448 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 ING4Q9UNL4 249 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 F8VVB4 439 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 F8VWA3 439 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 AIPO00170 330 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 WNT9BO14905 357 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 SSX4O60224 188 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 BCL3P20749 454 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 NPBWR2P48146 333 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 HFEQ30201 348 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 MKXQ8IYA7 352 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 GCSAMQ8N6F7 178 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 SLC25A46Q96AG3 418 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 BARHL1Q9BZE3 327 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 GSX2Q9BZM3 304 aa23.75■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF701M0R085 212 aaPredicted RBP23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 ZNF205O95201 554 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 CYB5AP00167 134 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 PGA5P0DJD9 388 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 CALCBP10092 127 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 IRF2P14316 349 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 PAX1P15863 534 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 CD80P33681 288 aa23.74■■□□□ 1.39
GIPC1-202ENST00000393028 RIN1Q13671 783 aa23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.3 ms