RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323929.7

MRE11-201, Transcript of MRE11 homolog, double strand break repair nuclease, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene MRE11, Length 6,897 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11-201ENST00000323929 PRRX1P54821 245 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RHOUQ7L0Q8 258 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR10V1Q8NGI7 309 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 DIRC2Q96SL1 478 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 HES7Q9BYE0 225 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ADAM19Q9H013 955 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 LPAR3Q9UBY5 353 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RCL1Q9Y2P8 373 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RAB19A4D1S5 217 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ANGPTL7O43827 346 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SULT1A3P0DMM9 295 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SULT1A4P0DMN0 295 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 CALCRP30988 508 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR10K2Q6IF99 312 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SLC16A12Q6ZSM3 486 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SFTPA2Q8IWL1 248 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 CMTM2Q8TAZ6 248 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 YIPF5Q969M3 257 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SLC52A3Q9NQ40 469 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 LCTP09848 1927 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 GUCA2AQ02747 115 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 COL19A1Q14993 1142 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 POM121L2Q96KW2 1035 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR6C3Q9NZP0 311 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 MTFP1Q9UDX5 166 aa6.66□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RPL12P30050 165 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 C3AR1Q16581 482 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 C20orf196Q8IYI0 205 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 PRSS27Q9BQR3 290 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 PTDSS2Q9BVG9 487 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 FZR1Q9UM11 496 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SBF1O95248 1867 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 A0A0U1RQK1 487 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 AHRRA9YTQ3 701 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SFT2D2O95562 160 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RPA2P15927 270 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RAG2P55895 527 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 BAK1Q16611 211 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 FAM27D1Q5T7N8 215 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 TCTE3Q8IZS6 198 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR8B3Q8NGG8 313 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RAB1CQ92928 201 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 MARC2Q969Z3 335 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OR8B2Q96RD0 313 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 PFDN5Q99471 154 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 ARV1Q9H2C2 271 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OCEL1Q9H607 264 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RAB18Q9NP72 206 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 FRRS1LQ9P0K9 344 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RPH3ALQ9UNE2 315 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 RAB27BO00194 218 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SNRNP70P08621 437 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 CEACAM6P40199 344 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 LIMS1P48059 325 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 PCOLCEQ15113 449 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 TMEM182Q6ZP80 229 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 CADM3Q8N126 398 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 MED30Q96HR3 178 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 FKBP11Q9NYL4 201 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 FLVCR2Q9UPI3 526 aa6.65□□□□□ -1.34
MRE11-201ENST00000323929 OOEPA6NGQ2 149 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 OIP5O43482 229 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 PRSS53Q2L4Q9 553 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 LINC00303Q3SY05 128 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 C1QL3Q5VWW1 255 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 FAAP20Q6NZ36 180 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 BTNL3Q6UXE8 466 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ZNF638Q14966 1978 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 OR5H14A6NHG9 310 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 C4orf51C9J302 202 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 NME2P1O60361 137 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 RAB5CP51148 216 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 FUT5Q11128 374 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ETFDHQ16134 617 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ZBTB37Q5TC79 503 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 AK3Q9UIJ7 227 aa6.65□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 A0A1W2PQM1 296 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ANKRD20A5PA0PJZ0 165 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 PPIHO43447 177 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 BCL2L11O43521 198 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ZIC2O95409 532 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 HOXA6P31267 233 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 BMI1P35226 326 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 CSN1S1P47710 185 aa6.64□□□□□ -1.35
MRE11-201ENST00000323929 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.1 ms