RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318988.10

CTDNEP1-201, Transcript of CTD nuclear envelope phosphatase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDNEP1, Length 1,549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDNEP1-201ENST00000318988 TLE4Q04727 773 aa23.27■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 UBE2NLQ5JXB2 153 aa23.27■■□□□ 1.32
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CTDNEP1-201ENST00000318988 OR10K2Q6IF99 312 aa23.24■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 C1orf123Q9NWV4 160 aa23.23■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
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CTDNEP1-201ENST00000318988 ATG5Q9H1Y0 275 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 MTCH1Q9NZJ7 389 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 COL12A1Q99715 3063 aa23.22■■□□□ 1.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 CD8AP01732 235 aa23.21■■□□□ 1.31
CTDNEP1-201ENST00000318988 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
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