RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000316786.1

C9orf106-201, Transcript of chromosome 9 open reading frame 106 (putative), humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf106, Length 3,145 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf106-201ENST00000316786 CALCRP30988 508 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 SRYQ05066 204 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HIST3H3Q16695 136 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TMPRSS12Q86WS5 348 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 C15orf54Q8N8G6 183 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZIC4Q8N9L1 334 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR10D3Q8NH80 312 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 RNF133Q8WVZ7 376 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa11.64□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FREM1Q5H8C1 2179 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 LOC102725191A0A1B0GVB3 256 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CASRP41180 1078 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 MAGEA5P43359 124 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CSNK1A1P48729 337 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 JMJD6Q6NYC1 403 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FDX2Q6P4F2 183 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FGD2Q7Z6J4 655 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 C1orf198Q9H425 327 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 RNF122Q9H9V4 155 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 G6PC2Q9NQR9 355 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 R4GMQ9 66 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 A8MWP6 167 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 NKX2-8O15522 239 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 MT-ND4LP03901 98 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HEXAP06865 529 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 BDKRB2P30411 391 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 RAC3P60763 192 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM255AQ5JRV8 349 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GALNT16Q8N428 558 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HAVCR2Q8TDQ0 301 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZFP3Q96NJ6 502 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 RBM24Q9BX46 236 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF69Q9UC07 566 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR14J1Q9UGF5 321 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR52A1Q9UKL2 312 aa11.63□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 RCC1P18754 421 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 Q6ZTK2 550 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FCRLAQ7L513 359 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ASB5Q8WWX0 329 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF703Q9H7S9 590 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TRBV5-7A0A0A0MS05 114 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 A0A0U1RQV5 110 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GJE1A6NN92 205 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HSPB2A8KAH6 182 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF705GA8MUZ8 300 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CDRT15L2A8MXV6 281 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 P2RY10O00398 339 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 PITPNBP48739 271 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 F2RL1P55085 397 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 MRPL49Q13405 166 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HSPB2Q16082 182 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 NCR3LG1Q68D85 454 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 PLPP7Q8NBV4 271 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR51S1Q8NGJ8 323 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ABHD3Q8WU67 409 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 NUDT11Q96G61 164 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FER1L6-AS2Q96M78 137 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FAM173AQ9BQD7 235 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ELOVL1Q9BW60 279 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 MFFQ9GZY8 342 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 SLITRK2Q9H156 845 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 METTL8Q9H825 291 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ABRACLQ9P1F3 81 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 FLVCR2Q9UPI3 526 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR14I1A6ND48 311 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TLX3O43711 291 aaPredicted RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ITGB2P05107 769 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CDKN1BP46527 198 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GFRA1P56159 465 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 BATFQ16520 125 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 PRSS45Q7RTY3 260 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TMPRSS7Q7RTY8 843 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TMEM123Q8N131 208 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ACBD4Q8NC06 268 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TNFRSF14Q92956 283 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 DOCK7Q96N67 2140 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 TTTY12Q9BZ98 90 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 KCNK15Q9H427 330 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GSKIPQ9P0R6 139 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ABI3Q9P2A4 366 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 DHDHQ9UQ10 334 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 CSAG2Q9Y5P2 127 aa11.62□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 LOC107986453A0A1B0GWG9 222 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 A0A1W2PPH5 198 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 LRP3O75074 770 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 ZNF432O94892 652 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 GOSR1O95249 250 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HOXB5P09067 269 aa11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 WT1P19544 449 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
C9orf106-201ENST00000316786 HOXA5P20719 270 aa11.61□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.6 ms