RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 CRISP1P54107 249 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MFGE8Q08431 387 aaPredicted RBP15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC75BQ2VPJ9 315 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SMIM21Q3B7S5 101 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF684Q5T5D7 378 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 SPATA24Q86W54 205 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 OR5K1Q8NHB7 308 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 MEGF9Q9H1U4 602 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJB9Q9UBS3 223 aa15.96■□□□□ 0.15
CXCL3-201ENST00000296026 CMYA5Q8N3K9 4069 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PPH5 198 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 SLC1A7O00341 560 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 FKBP6O75344 327 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 TTRP02766 147 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PRDX2P32119 198 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 KIR2DS4P43632 304 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 HAAOP46952 286 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 EFNB2P52799 333 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 RPL31P62899 125 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 FLOT2Q14254 428 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 HERPUD1Q15011 391 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM200BQ69YZ2 307 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 Q6ZTK2 550 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF573Q86YE8 665 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF561Q8N587 486 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR4C13Q8NGP0 309 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 HEXA-AS1Q9H8Q6 139 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PAPOLBQ9NRJ5 636 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa15.95■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 J3QT63 122 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 SRSF10O75494 262 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PGA5P0DJD9 388 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 AANATQ16613 207 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CLVS2Q5SYC1 327 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CRIP3Q6Q6R5 217 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf42Q8N5U0 333 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR4M1Q8NGD0 313 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR2T27Q8NH04 317 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 DNAJC9Q8WXX5 260 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 GPR173Q9NS66 373 aa15.94■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PRKYO43930 277 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 NOS1APO75052 506 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 NXPH2O95156 264 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CCL3L1P16619 93 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ESRRGP62508 458 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf88Q6PI97 169 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF322Q6U7Q0 402 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 BATF2Q8N1L9 274 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR2T6Q8NHC8 308 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 APOL4Q9BPW4 351 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 RAB18Q9NP72 206 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 USE1Q9NZ43 259 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 FOXJ3Q9UPW0 622 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa15.93■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PPE2 198 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PR64 198 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1W2PRV1 198 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PQLC2LA1A4F0 135 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 DLGAP1O14490 977 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 MAGEB4O15481 346 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 COX7A1P24310 79 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 BMXP51813 675 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 LGALS4P56470 323 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ERVFRD-1P60508 538 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CXCR4P61073 352 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 BCL2L15Q5TBC7 163 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM42Q69YG0 159 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 FAHD1Q6P587 224 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ASRGL1Q7L266 308 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ELMOD2Q8IZ81 293 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 C11orf44Q8N8P7 122 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 NRBF2Q96F24 287 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 NRIP2Q9BQI9 281 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 RANBP3Q9H6Z4 567 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 MOB1AQ9H8S9 216 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR14J1Q9UGF5 321 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR52A1Q9UKL2 312 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 V9GYS6 101 aa15.92■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A0A1B0GTI1 187 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 A6NIN4 97 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 GYG2O15488 501 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 CHST1O43916 411 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 DAPP51397 102 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ACTR3P61158 418 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF273Q14593 569 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF782Q6ZMW2 699 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PLEKHG7Q6ZR37 379 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 SLC35F2Q8IXU6 374 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 KLHDC1Q8N7A1 406 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 OR14K1Q8NGZ2 314 aa15.91■□□□□ 0.14
CXCL3-201ENST00000296026 PIFOQ8TCI5 191 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.8 ms