RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265339.6

UBE2B-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2B, Length 2,515 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-201ENST00000265339 MST1LQ2TV78 715 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 Q8NA96 180 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ABHD3Q8WU67 409 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TREM2Q9NZC2 230 aa17.78■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TRAV8-7A0A075B6U6 113 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 A6NLC8 198 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 CTAG2O75638 210 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 MT-ND4LP03901 98 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 AMY2AP04746 511 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 CD2P06729 351 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 PAX6P26367 422 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 NCMAPQ5T1S8 102 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 FAM220AQ7Z4H9 259 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ZIC4Q8N9L1 334 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 OR6X1Q8NH79 312 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TUBD1Q9UJT1 453 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM127O75204 238 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 UPK3AO75631 287 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 PGA4P0DJD7 388 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 PGA3P0DJD8 388 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 CTLA4P16410 223 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 FMODQ06828 376 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 SRSF4Q08170 494 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 ALKBH1Q13686 389 aaKnown RBP17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 OR51D1Q8NGF3 324 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 OR10AC1Q8NH08 325 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 FNDC9Q8TBE3 224 aa17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A44Q96H78 314 aaPredicted RBP17.77■□□□□ 0.44
UBE2B-201ENST00000265339 METTL21EPA6NDL7 271 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SYNGR4O95473 234 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RPS27P42677 84 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CARD17Q5XLA6 110 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ANKRD16Q6P6B7 361 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLC30A7Q8NEW0 376 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RNF128Q8TEB7 428 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ISOC2Q96AB3 205 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RHOVQ96L33 236 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PRDM14Q9GZV8 571 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 KCNK15Q9H427 330 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PRORYQ9H606 182 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TVP23AA6NH52 213 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 EEF1E1-BLOC1S5C9J1V9 151 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 AGPAT2O15120 278 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A7O60669 478 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CRYABP02511 175 aaKnown RBP17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TACSTD2P09758 323 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SSX9Q7RTT3 188 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 NOXO1Q8NFA2 376 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 IKZF2Q9UKS7 526 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 B9D1Q9UPM9 204 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CACNA1CQ13936 2221 aa17.76■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 IGHG1P01857 330 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR2B8PP59922 312 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLC16A9Q7RTY1 509 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 OR51A4Q8NGJ6 313 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SLC25A21Q9BQT8 299 aaPredicted RBP17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 hCG_1809904A0A1W2PP81 198 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PR64 198 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 A0A1W2PRV1 198 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF726A6NNF4 738 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 F8VVB4 439 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 F8VWA3 439 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 AP4M1O00189 453 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 GPANK1O95872 356 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 WNT11O96014 354 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CSN2P05814 226 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FAM157CP0CG43 387 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CAV2P51636 162 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CLRN1P58418 232 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FAM76BQ5HYJ3 339 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 DCUN1D4Q92564 292 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TOLLIPQ9H0E2 274 aa17.75■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 HTR5AP47898 357 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FAM180AQ6UWF9 173 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 RHOUQ7L0Q8 258 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 NUDCD2Q8WVJ2 157 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 FOXN4Q96NZ1 517 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 MICU1Q9BPX6 476 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 LPAR3Q9UBY5 353 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 PPIHO43447 177 aaKnown RBP17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 ZNF432O94892 652 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 CD80P33681 288 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 NTF4P34130 210 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TAS2R19P59542 299 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 HGFACQ04756 655 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 BIVMQ86UB2 503 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 TMEM123Q8N131 208 aa17.74■□□□□ 0.43
UBE2B-201ENST00000265339 SARAFQ96BY9 339 aa17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.7 ms