RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000258243.6

URB2-201, Transcript of URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene URB2, Length 5,613 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
URB2-201ENST00000258243 ZNF117Q03924 483 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 MAJINQ3KP22 176 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NCR3LG1Q68D85 454 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TSEN54Q7Z6J9 526 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 FAM3DQ96BQ1 224 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NDFIP1Q9BT67 221 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SOX7Q9BT81 388 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 FAM60AQ9NP50 221 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 RNF24Q9Y225 148 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NRXN2Q9P2S2 1712 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CRXO43186 299 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SLC2A10O95528 541 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GP1BAP07359 652 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 FZD5Q13467 585 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PLPP7Q8NBV4 271 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 APOBEC3DQ96AK3 386 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ATAD5Q96QE3 1844 aa9.75□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 KIR2DS1A0A191URI9 304 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR4C45A6NMZ5 311 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 KIR2DS4P43632 304 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 KIR2DS1Q14954 304 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CLLU1Q5K131 121 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 BATF2Q8N1L9 274 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 LSMEM1Q8N8F7 131 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR10J5Q8NHC4 309 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GNPNAT1Q96EK6 184 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 AMDHD2Q9Y303 409 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR2F2O95006 317 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CD160O95971 181 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CRISP2P16562 243 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TAS2R60P59551 318 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 RHOBP62745 196 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 EGR3Q06889 387 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR2F1Q13607 317 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TUSC1Q2TAM9 212 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 FAAP20Q6NZ36 180 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CALHM3Q86XJ0 350 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SLC6A13Q9NSD5 602 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 WDR1O75083 606 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ZP3P21754 424 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GABRA4P48169 554 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GPM6AP51674 278 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PPP1CBP62140 327 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR10D3Q8NH80 312 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NUBPLQ8TB37 319 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 RAB37Q96AX2 223 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 WDR34Q96EX3 536 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PLK3Q9H4B4 646 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PILRBQ9UKJ0 227 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 A0A0B4J203 849 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ALG1L2C9J202 215 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CD3EP07766 207 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 FABP2P12104 132 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OMGP23515 440 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 KLRB1Q12918 225 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SLC35G3Q8N808 338 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SHARPINQ9H0F6 387 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NUMA1Q14980 2115 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CDX4O14627 284 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 HSD17B6O14756 317 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 UBE2IP63279 158 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 LIPNQ5VXI9 398 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 PLXDC2Q6UX71 529 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TMEM251Q8N6I4 163 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 JAM3Q9BX67 310 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GPR84Q9NQS5 396 aa9.74□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 MCM3APO60318 1980 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ARRDC5A6NEK1 342 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 AP4M1O00189 453 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 NDUFB3O43676 98 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SUCLG1P53597 346 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 RAC1P63000 192 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 CLEC12BQ2HXU8 276 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SMIM21Q3B7S5 101 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 VN1R4Q7Z5H5 301 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 MEGF10Q96KG7 1140 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 WDR54Q9H977 334 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 SIRT3Q9NTG7 399 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TAS2R4Q9NYW5 299 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 A0A1W2PPQ1 181 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ANKRD61A6NGH8 418 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ACTL6AO96019 429 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TAS2R45P59539 299 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 GNB1P62873 340 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ADIPOQQ15848 244 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 TMEM88Q6PEY1 159 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 MRGPREQ86SM8 312 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 OR52L2PQ8NGH6 319 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 RAB1BQ9H0U4 201 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 AUNIPQ9H7T9 357 aa9.73□□□□□ -0.85
URB2-201ENST00000258243 ZNF835Q9Y2P0 537 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.3 ms