RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000234111.8

ODC1-201, Transcript of ornithine decarboxylase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ODC1, Length 2,653 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODC1-201ENST00000234111 SHDQ96IW2 340 aa18.67■□□□□ 0.58
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ODC1-201ENST00000234111 OR1P1Q8NH06 330 aa18.64■□□□□ 0.57
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ODC1-201ENST00000234111 ELSPBP1Q96BH3 223 aa18.64■□□□□ 0.57
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ODC1-201ENST00000234111 PRR22Q8IZ63 422 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 BAHD1Q8TBE0 780 aaPredicted RBP18.63■□□□□ 0.57
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ODC1-201ENST00000234111 AHSA1O95433 338 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 DBHP09172 617 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 NPSP0C0P6 89 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 DEGS2Q6QHC5 323 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 CLDND2Q8NHS1 167 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 SLAMF6Q96DU3 332 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 DKKL1Q9UK85 242 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa18.63■□□□□ 0.57
ODC1-201ENST00000234111 MTCH2Q9Y6C9 303 aa18.63■□□□□ 0.57
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