RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000227065.8

FAM149A-201, Transcript of family with sequence similarity 149 member A, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene FAM149A, Length 2,708 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM149A-201ENST00000227065 TCEAL3Q969E4 200 aa23.69■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF251Q9BRH9 671 aa23.69■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 STARD10Q9Y365 291 aa23.69■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TXNL1O43396 289 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PRF1P14222 555 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 AGAP20933 346 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PAX6P26367 422 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 IGSF11Q5DX21 431 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SMRP1Q8NCR6 262 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TOMM40LQ969M1 308 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 LIME1Q9H400 295 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF581Q9P0T4 197 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 S100A8P05109 93 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 NQO2P16083 231 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 NXPH1P58417 271 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM176BQ3YBM2 270 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A53Q5H9E4 307 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ADAM5Q6NVV9 412 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 OPN5Q6U736 354 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF561Q8N587 486 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 LYPD6BQ8NI32 183 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 OXGR1Q96P68 337 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 NAT2P11245 290 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TSPO2Q5TGU0 170 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TGIF2Q9GZN2 237 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SH3BGRL3Q9H299 93 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 WFDC1Q9HC57 220 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF160Q9HCG1 818 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 POMT1Q9Y6A1 747 aa23.68■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 OR2J2O76002 312 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 RRADP55042 308 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 GRB2P62993 217 aaKnown RBP23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 FAM3AP98173 230 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 S100A13Q99584 98 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SCRT1Q9BWW7 348 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 MASP2O00187 686 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 MSTNO14793 375 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 IFNA21P01568 189 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 CARFQ8N187 725 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TUBD1Q9UJT1 453 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 FBXO7Q9Y3I1 522 aa23.67■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 A0A1W2PPE2 198 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 MBPP02686 304 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 CLDN17P56750 224 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 HIST3H3Q16695 136 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM156Q8N614 296 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 UBAC2Q8NBM4 344 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 REEP6Q96HR9 211 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 LMAN1LQ9HAT1 526 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SHANK1Q9Y566 2161 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SERPINE3A8MV23 424 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TIAF1O95411 115 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 MSX1P28360 303 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 CD300LFQ8TDQ1 290 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PADI1Q9ULC6 663 aa23.66■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 OR5H15A6NDH6 313 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TMEM225BP0DP42 221 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 OPRM1P35372 400 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 CAMLGP49069 296 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ZNF84P51523 738 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 KCNMB1Q16558 191 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 RHBDD2Q6NTF9 364 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 RNF138Q8WVD3 245 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 WDR77Q9BQA1 342 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 RAB5AP20339 215 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 RNF212Q495C1 297 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 NKAIN1Q4KMZ8 207 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 MIOXQ9UGB7 285 aa23.65■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 UMAD1C9J7I0 102 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PRH1P02810 166 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 ASCL1P50553 236 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 PIGPP57054 158 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 LRRC18Q8N456 261 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 SEMA5BQ9P283 1151 aa23.64■■□□□ 1.38
FAM149A-201ENST00000227065 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 OR8U8P0C7N1 319 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 GLB1P16278 677 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 GLP1RP43220 463 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 ALDH3B1P43353 468 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 PRSS12P56730 875 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 NSUN5P2Q63ZY6 315 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 OR2M3Q8NG83 312 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 SEBOXQ9HB31 216 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 MYOTQ9UBF9 498 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 PIGLQ9Y2B2 252 aa23.64■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 OR13C7P0DN81 318 aa23.63■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 SLC25A45Q8N413 288 aa23.63■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 FXYD4P59646 89 aa23.63■■□□□ 1.37
FAM149A-201ENST00000227065 CHAF1BQ13112 559 aa23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.4 ms