RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000060969.5

SIKE1-201, Transcript of suppressor of IKBKE 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SIKE1, Length 2,190 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIKE1-201ENST00000060969 XRCC2O43543 280 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 NGFP01138 241 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CHRM2P08172 466 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 UBE2MP61081 183 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CLVS2Q5SYC1 327 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 DCAF12L2Q5VW00 463 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM65Q6PI78 240 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 C11orf88Q6PI97 169 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ZADH2Q8N4Q0 377 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 OR51T1Q8NGJ9 327 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SCARB1Q8WTV0 552 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SPSB4Q96A44 273 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 WBP1Q96G27 269 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ARL6Q9H0F7 186 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CST11Q9H112 138 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CRIM1Q9NZV1 1036 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF391Q9UJN7 358 aa16.11■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 H3BUI4 141 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 AQP7O14520 342 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SCO1O75880 301 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SCGNO76038 276 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 AMY2AP04746 511 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM225BP0DP42 221 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 GK2Q14410 553 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 NKPD1Q17RQ9 610 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 PIGCQ92535 297 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SPSB1Q96BD6 273 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 POM121L2Q96KW2 1035 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 A0A1W2PR80 420 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 TMEM82A0PJX8 343 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 OR4E1P0C645 316 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF735P0CB33 412 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ARR3P36575 388 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 RGS7BPQ6MZT1 257 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 TFAP2EQ6VUC0 442 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 C12orf45Q8N5I9 185 aaPredicted RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 S100A13Q99584 98 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 REG4Q9BYZ8 158 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 GP6Q9HCN6 339 aa16.1■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 BSNQ9UPA5 3926 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CD74P04233 296 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 BAMBIQ13145 260 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 GSG1LQ6UXU4 331 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 MDP1Q86V88 176 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CD163Q86VB7 1156 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SLC38A6Q8IZM9 456 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 C9orf106Q8NAJ2 232 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 OR56B2PQ8NGI1 322 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SLC6A7Q99884 636 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 OR51B6Q9H340 312 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 SDHAF2Q9NX18 166 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 LUZP4Q9P127 313 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 GHRLQ9UBU3 117 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 MFSD2BA6NFX1 497 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 NMBP08949 121 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 COX5BP10606 129 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 FOXC1Q12948 553 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 PLCXD3Q63HM9 321 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 MOB3CQ70IA8 216 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CNEP1R1Q8N9A8 125 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 BORCS8Q96FH0 119 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 GPR160Q9UJ42 338 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 STARD10Q9Y365 291 aa16.09■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 CACNA1GO43497 2377 aa16.08■□□□□ 0.17
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF816-ZNF321PA0A0X1KG74 233 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF850A8MQ14 1090 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 MFNGO00587 321 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 RPA2P15927 270 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 RBP2P50120 134 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 BPIFB2Q8N4F0 458 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 COQ8AQ8NI60 647 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 IFT46Q9NQC8 304 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 PLSCR2Q9NRY7 297 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.08■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 RFPL4AA6NLU0 287 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 LYZL6O75951 148 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 PRKACBP22694 351 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 IGHV1-2P23083 117 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 BLVRBP30043 206 aaPredicted RBP16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 WNT5AP41221 380 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 PLP2Q04941 152 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 TSC22D1Q15714 1073 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.07■□□□□ 0.16
SIKE1-201ENST00000060969 FAM214BQ7L5A3 538 aa16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.2 ms